湖泊中的微生物作为湖泊中有机质最重要的分解者和微食物网中的重要环节,不仅在湖泊营养盐的生物地球化学过程中起着极为关键的作用,加之它们生长速度快、对湖泊环境的变化极为敏感,常常会被作为湖泊生态系统演化的理想指标,可以及时有效的反映水体的污染情况及其生境变化情况。湖泊表层水体中的微生物,容易受光照、温度、溶解氧及营养盐等因素的影响,且微生物群落结构与环境因子之间的关系会随着区域的改变而变化。湖泊沉积物由多种生物共同参与构成,其中各类物质间频繁发生交换的生物非生物混合体。湖泊中环境条件的变化和各类营养物质的流入等都会造成湖泊水体与沉积物中细菌多样性的变化。细菌在湖泊生境中参与有机物的分解及沉降及营养物质的循环,为生物的代谢活动提供场所。湖泊中环境因子的变动直接影响湖泊环境中微生物群落的多样性和组成结构。因此研究湖泊水体及沉积物中的细菌多样性及组成结构,将有助于对湖泊生境的进一步了解和认识。本文通过高通量测序技术对内蒙岱海湖水体和沉积物中细菌的多样性和群落组成以及水体环境因子间的相互作用进行了研究。比较分析岱海湖各样点沉积物及水体微生物多样性异同,分析微生物多样性与环境非生物因子的相关性,以期了解岱海湖水体及沉积物中微生物的多样性,为后续进一步展开对岱湖中细菌及其他资源的分析研究、湖泊生态系统的修复与可持续发展具有重要依据。研究结果表明,在门水平上,优化后的序列经筛选共归于58个门中。岱海湖沉积物细菌隶属于58个门,变形菌门（Proteobacteria,49%）、拟杆菌门（Bacteroidetes,11%）、绿弯菌门（Chloroflexi,8%）占比最高,其次为厚壁菌门（Firmicutes,6%）、蓝藻细菌门（Cyanobacteria,5%）、浮霉菌门（Planctomycetes,3%）、放线菌门（Actinobacteria,3%）、硝化螺旋菌门（Nitrospirae,2%）、酸杆菌门（Acidobacteria,1.74%）、螺旋体门（Spirochaetae,1.58%）、Ignavibacteriae（1.32%）以及柔膜菌门（Tenericutes,0.32%）等共占25%。水体细菌隶属于29个门,放线菌门（45%）,变形菌门（26%）、拟杆菌门（16%）、柔膜菌门（13%）占主导地位,其他一些观察到的门类比例较低包括蓝藻细菌门（0.45%）,疣微菌门（Verrucomicrobia,0.18%）,厚壁菌门（0.15%）等。相较与水体中的浮游细菌类群而言沉积物中的细菌多样性更高,物种更为丰富。本次沉积物样本中除了蕴含水体中全部的细菌类群外,还含有29个特异门类,分别为绿弯菌门（Chloroflexi）、硝化螺旋菌门、浮霉菌门、酸杆菌门、Ignavibacteriae、螺旋体门（Spirochaetae）、Aminicenantes、脱铁杆菌门（Deferribacteres）、异常球菌-栖热菌门（Deinococcus-Thermus）等。另外,沉积物细菌群落中的未知类群的占比是水体细菌中类群的20倍,多样性更为丰富。从细菌门的角度看,岱海湖沉积物细菌与水体细菌群落之间的种类组成差异显著。岱海湖水体和沉积物中微生物有较高的丰度和丰富的多样性。沉积物中细菌OTUs（Operational Taxonomic Units）为3253;水体中细菌的OTUs为640,沉积物较水体中细菌群落更加多样化。岱海湖沉积物中细菌种类隶属于58门,782属,其优势种群为变形菌门（Proteobacteria,49%）、拟杆菌门（Bacteroidetes,11%）、绿弯菌门（Chloroflexi,8%）和厚壁菌门（Firmicutes,6%）;水体中细菌隶属于29门318属,优势种群为放线菌门（Actinobacteria,45%）、变形菌门（26%）、拟杆菌门（Bacteroidetes,16%）和柔膜菌门（Tenericutes,13%）。研究结果还表明,岱海湖沉积物细菌群落与水体细菌群落结构间差异性显著。岱海湖受损点P-IBI数值位于Ⅲ级,参照点P-IBI数值位于Ⅱ级。说明在岱海工厂周围的湖水水体是受到了一定程度的污染的,此处已经偏离了原始状态,生物群落完整性也受到影响,而参照点据污染源距离较远,健康状况相对较好,但是没有达到Ⅰ级标准,可能是由于污染扩散导致整个水体均受到一些污染,也可能是由于人为原因或者降雨对岱海水体造成了污染,使其没能保持最初的良好状态。