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本论文采用PCR-PAGE方法,分析了四川三个藏猪群体18个微卫星座位的遗传多样性及其在世代间的变异,根据所检测的微卫星多态性分析了群体之间的遗传分化情况。研究结果表明:四川藏猪三个群体在18个微卫星座位上有108个等位基因,平均每个座位有6.0000个等位基因。其中,108个阿坝藏猪在18个座位共检测到61个等位基因,平均为3.3889个;18个稻城藏猪在18个座位检测到70个等位基因,平均为3.8889个;17个德格藏猪在18个座位检测到72个等位基因,平均为4.0000个。三个群体在18个微卫星座位的平均有效等位基因数在1.4980-3.4791之间。阿坝群体平均有效等位基因数为2.1301,稻城群体平均有效等位基因数为2.6957,德格群体平均有效等位基因数位2.5014。各微卫星座位上等位基因的分布在群体间不均衡,各群体各微卫星座上均有自己独特的等位基因。从微卫星座位分析,18个微卫星座位的平均多态信息含量在0.2774-0.6535之间,SW2442、S0227、IGF1、SW1202、S0101、SW268、SW951、SW66、S0004、S0026、SW24等11个座位表现为中度多态性,ALPHA、SW1443、SW911、SW957、SW2459、SW886、SW787等7个座位表现为高度多态性。从三个群体分析,平均多态信息含量在0.4071-0.5306之间,阿坝群体表现为中度多态性,稻城和德格群体表现为高度多态性。通过杂合度、F统计量和遗传距离分析,三个群体18个微卫星座位的杂合度各不相同,各微卫星座位的平均杂合度在0.0216 (IGF1)-0.6356 (SW2459)之间,阿坝、稻城、德格三群体的平均杂合度分别为0.2130、0.3272和0.3562;群体间的遗传变异为21.54%,相互间的遗传距离均在0.6以上,平均基因流值大于1。表明三个群体各有特点,群内基因交流频繁、杂合度较低。对阿坝群体各微卫星座位世代间的多样性分析结果表明,各微卫星座位的多态信息含量保持相对稳定,杂合度随世代的增加逐代下降,群体渐趋纯合。