高技术产业以其成长迅速、对其他产业带动作用强、在一定时间内能产出大量利润等特点,日益成为各个国家和地区关注和竞争的重点,其技术创新活动及其成果已成为中国当前和未来经济发展新的增长点。各国都在加大对技术创新投入的力度,但由于各国所处的经济发展阶段不同、所拥有的自然资源存在差异、人员和资金配备不同等原因,创新投入所获得的创新产出不尽相同。虽然我国高技术产业近几年来成绩不俗,但大量数据显示出其高速发展主要是靠高投入带动的,效率并非有很大的提升,且在关键设备和高端产品等方面明显落后于发达国家,出口的创新产品中,也鲜有核心专利技术产品。创新资源的匮乏使得我国在加大人力、资金投入的同时,还应该注重提高效率。而要提高效率,应先建立合理有效效率评价指标体系,采用合理有效的方法进行评价,才能找出现阶段我高技术产业技术创新活动中存在的问题,并针对这些问题提出合理有效的建议。本文认为,创新活动从科技研发到收益实现的过程并不是一蹴而就的,而是分阶段、有次序的开展。因此,本文从投入产出的角度入手,以DEA模型为基础,测量了中国1998-2012年中国各省市高技术产业的技术创新效率,并对高技术产业技术创新效率的影响因素进行实了证研究。研究表明,在1998-2010年间,中国高技术产业创新存在区域发展不平衡的现象,各地区随时间变化的创新效率值波动也比较大,大致呈“多V”型发展趋势,创新三阶段效率也多为低基础性创新效率、低应用性创新效率、低收益性创新效率型。而在影响三阶段创新效率的诸多因素中,信息技术发展、企业自主创新对创新三个阶段的正向影响显著;金融机构支持对基础性创新和应用性创新阶段负向影响显著;政府科技支持对基础性创新阶段负向影响显著、对收益性创新阶段正向影响显著;企业规模对基础性创新阶段负向影响显著,对应用性创新与收益性创新阶段正向影响显著。