转基因生物是指具有凭借现代生物技术获得的遗传材料新型组合的活生物体。鉴于转基因生物本身安全性问题没有得到科学的确认，其对人类、动植物的健康和环境可能存在着不确定的风险。《生物多样性公约》及其议定书毋庸置疑是国际立法中对转基因生物安全进行规制的最重要的国际法规则。《生物多样性公约》及其议定书的内容从规制转基因生物安全出发，在目标中对风险预防原则进行了强调。在实施机制方面所倡导的提前知情同意程序是十分完善、实用的。但是《生物多样性公约》及其议定书还是存在需要完善的部分：关于赔偿责任的规定迫切需要补充；世界大国只有一小部分参与其中，应继续鼓励大国的加入：由于转基因生物产品作为国际贸易的一种，提前知情同意程序的采取领域必须紧跟实际情况不断扩大。在保护转基因生物安全的问题上，《生物多样性公约》及其议定书的众多条款与WTO条款经常因适用冲突引起纠纷。《议定书》条款与WTO条款在具体的细则规定有着明显的分歧，在目标和原则方面的相悖也使两个条约体系的国际立法地位模棱两可。另外WTO拥有国际组织中最完备的争端解决机制，《议定书》在这个方面尚未起步，并无具体适用规定。所以说转基因生物安全不可避免地存在着风险，这种潜在的风险严重影响了生物多样性的保护工作，因此对转基因生物安全的国际法规则的完善提供一些建议是十分必要的。本文运用了规范分析和案例分析的方法，主要分析了相关的WTO多边协议的有关内容，并且结合相关案例进行从理论到实践的论证，同时，对转基因生物安全的立法完善提出了相应的建议。