科研经费是知识生产、科技创新的基本条件和重要保障,是科研活动赖以进行的物质基础之一。随着我国教育事业的不断发展和规模的扩大,我国高校承担的科研项目和筹措的科研经费也在呈现出大幅度增长趋势,科研经费已经成为学校重要的资金来源之一。但是我国高校科研项目和经费在管理上往往是分离的,管理项目部门和管理经费部门经常会相互推诿扯皮,容易造成漏洞,不利于科研经费发挥更大的经济效益。如何结合学校实际,加强对高校科研经费使用的管理,探索适合高等学校科研发展有效的科研经费管理模式,使科研项目管理与科研经费管理有机结合,保证高校科研工作有序高效进行,已经是一件非常重要的事情。本文以高等学校科研经费管理模式为研究主题,在对我国高等学校科研经费管理的现状、存在问题和原因进行分析以及对国外发达地区高等学校科研经费管理模式的经验进行借鉴的基础上,构建了我国高等学校科研经费管理模式:项目管理与经费管理有机统一的科研经费管理模式,在该管理模式下,分别探讨了纵向和横向课题经费管理特点以及科研经费校院二级管理的具体模式,最后对西北农林科技大学科研经费校院二级财务管理模式进行了实证分析,并提出了完善高校科研经费管理模式的建议。本文所构建的高等学校科研经费的管理模式—项目管理与经费管理有机统一的经费管理模式,是在分析我国高校现行科研经费管理机制各个环节和出现的问题的基础上提出来的,是我国高等学校科研经费管理模式的创新,具有较强的应用价值和可操作性。同时,也对西北农林科技大学实行的科研经费校院二级财务管理具体模式进行了实证分析,在此基础上,提出了加强高校科研经费二级财务管理模式的政策建议,树立以人为本的管理理念;统筹协调,合理配置科研资源;完善二级财务核算机构;完善科研财务管理办法,提高科研资金的使用效益;建立科研收入分配的激励机制;等等。本文的创新之处主要在于:(1)构建出了我国高等学校科研经费的管理模式:即项目管理和经费管理有机统一的管理模式。(2)探讨了西北农林科技大学科研经费校院二级财务管理的具体模式,区分了横向和纵向课题经费的管理特点。