我国1989年《行政诉讼法》虽然没有对行政机关负责人出庭应诉的制度作出规定,但其中的一些条款却蕴含着要求和鼓励行政机关负责人出庭应诉的精神和价值取向。在推动行政机关负责人出庭应诉制度写入新《行政诉讼法》的历史进程中,作为中央人民政府的国务院和众多的地方政府分别以制定一系列行政性文件和进行大量的实践探索的方式发挥了重要作用。修改后的《行政诉讼法》自2015年5月颁布后,虽然确立了行政机关负责人出庭应诉的制度,但因过于原则和不具体,不利于操作和执行,国务院办公厅于2016年6月27日发布的《关于加强和改进行政应诉工作的意见》亦是如此,这就为我们探索寻找完善的路径留下了空间。本文在分析几种可能的完善路径的基础上,提出应当由国务院就关于加强行政机关负责人出庭应诉工作提出意见,用以指导全国各级行政机关,并就具体内容的设计提出设想和建议,包括:充分认识加强行政机关负责人出庭应诉工作的重要性;加强行政机关负责人出庭应诉工作的具体要求;加强行政机关负责人出庭应诉的保障措施,并在此基础上拟出学术建议稿。