本研究以江苏省兴化市蔬菜供应链为例，通过实地调查，描述了江苏省兴化市传统生鲜蔬菜供应链、传统加工蔬菜供应链、横向合作生鲜蔬菜供应链和纵向合作加工蔬菜供应链；采用多元Logit模型分析农户选择加入新型蔬菜供应链的影响因素；并采用统计检验方法对蔬菜供应链上游节点中农户的成本收益进行了比较研究。对江苏省兴化市244户蔬菜种植户进行问卷调查，描述了传统生鲜蔬菜供应链、传统加工蔬菜供应链，以及新型蔬菜供应链：农户联合的横向合作蔬菜供应链，农户与蔬菜加工厂松散联合的纵向合作供应链。新型蔬菜供应链为农户提供技术指导服务等，农户从合作中获取一定的利益。实证结果表明：农户在面对横向合作供应链和传统供应链时，蔬菜销售收入、有可用于生产投入的资金这两个因素对其选择加入横向合作供应链具有显著的正效应，专业程度、技术指导可获性、农资可获性、抵御自然风险能力、讨价还价能力、农残超标退货六个因素对其选择加入横向合作供应链具有显著的负效应；农户在面对纵向合作供应链和传统供应链时，当过干部、专业程度、有可用于生产投入的资金三个因素对其选择加入纵向合作供应链具有显著的正效应，文化程度、技术指导可获性、市场信息可获性、抵御自然风险能力、农残超标退货六个因素对其选择加入纵向合作供应链具有显著的负效应；农户在面对横向合作供应链和纵向供应链时，市场信息可获性对其选择加入横向合作供应链具有显著的正效应，专业程度、技术指导可获性、农资可获性、讨价还价能力四个因素对其选择加入横向合作供应链具有显著的负效应。采用两独立样本参数检验和两独立样本非参数检验方法，对处于不同类型供应链中的农户成本收益进行比较分析，发现不同类型供应链在某项成本支出上存在显著差异，但是在总成本上差异不大，横向合作供应链农户总收益高于传统供应链，纵向合作供应链农户总收益低于传统供应链。虽然横向合作和纵向合作都能给农户带来好处，特别是所提供的技术指导服务能提高农产品质量和安全，但是就农户的投入产出利益而言，横向合作供应链优于传统供应链，传统供应链优于纵向合作供应链。