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手足口病是一种常见的急性传染病，5岁以下的婴幼儿高发。大多数病例症状轻微，仅表现为手、足、口等部位出现皮疹，少数病例会出现神经系统并发症，2008年5月2日，我国将手足口病归入丙类传染病。目前针对手足口病没有特别有效的抗病毒药物、疫苗和治疗手段，因此大力开展手足口病病原学的基础研究，会对病毒感染机理的阐明、疫苗的开发、疾病的控制起到重要的作用。本课题与长春市疾病预防控制中心合作，于2012-2013年共采集到手足口病疑似病例咽拭子和疱疹液样本共52份。将临床标本进行病毒的分离和鉴定：RD细胞用于病毒的分离培养，标本接种后可出现细胞逐渐变圆、体积缩小、胞浆内颗粒增加、折光性增强、最后脱落等典型的细胞病变效应(CPE)。阳性标本提取病毒RNA，肠道病毒通用引物RT-PCR结果显示42份样本出现特异性单一条带，标本阳性率为84%。HEV71特异性引物和CVA16特异性引物RT-PCR结果显示：2012年临床标本中HEV71共14株（占77.78%），CVA16共2株（占11.11%），其他肠道病毒2株（占11.11%）；2013年临床标本中HEV71共12株（占50.00%），CVA16共11株（占45.83%），其他肠道病毒1株（占4.16%）。序列测定及系统进化分析结果显示：长春地区HEV71属于C4a亚型、CVA16属于B2b亚型。对2012-2013年手足口病病原学构成、患者发病时间、发病年龄和性别构成进行统计学分析，结果显示2012-2013年手足口病病原学构成（χ2=5.983，P<0.05）、手足口病患者发病时间（χ2=10.536，P<0.05）有显著性差异；手足口病患者发病年龄（χ2=0.571，P＞0.05）和性别构成（χ2=0.667，P＞0.05）无差异。本研究成功的从长春地区手足口病患者体内分离出42株肠道病毒临床株，主要病原体为HEV71和CVA16。HEV71属于C4a亚型，CVA16属于B2b亚型。统计学分析结果显示，2012-2013年手足口病病原学构成、发病时间有所变化；而手足口病患者性别构成和年龄分布没有显著性变化。