本文针对通信系统间电磁兼容预测分析软件设计需求，提出预测分析软件总体设计方案，讨论了基于作战层次进行同址干扰分析、群组干扰分析、集群干扰分析的电磁兼容预测方法。基于干扰预测分析三要素，详细讨论了发射机、接收机、天线耦合度模型建立过程和内容。与传统系统间电磁兼容预测分析软件不同，本软件同地理信息数据库互联获取地理信息数据文件，同装备数据库互联获取装备设备详细信息，同模型数据库互联获取发射特性、接收特性、天线特性、电波传输特性精确模型。本软件以地理信息数据库和装备信息数据库作为数据支撑，可大量获取地理位置信息和装备设备详细参数信息，提高了预测分析的实效性；以实测数据拟合的精确模型库作为模型支撑，有效的减少了应用传统理论模型进行计算的误差，达到精确预算的目的，提高预测分析的准确性。本预测分析软件可以和各个互联的数据库实现局域分布式互联，各个数据库和预测分析软件可以独立配置。预测分析软件以NET FrameWork4.0为平台，以VS2010作为开发工具，连接Sql Sever数据库，编写了基于C#语言的UI人性化界面，完成通信系统间电磁兼容分析软件设计实现，并辅以预测分析实例，说明本软件具有分析指导作用，达到设计需求。