芥菜（Brassica juncea）是十字花科芸薹属的一个重要蔬菜,品种类型丰富,包含多种特殊的农艺性状,具有重要的经济价值。结球是蔬菜特有的农艺性状,具有方便运输、耐储存等优点;而表皮毛普遍分布于植物的地上部分,影响植物的蒸腾作用,对这两个性状的研究都将对培育出具有特定性状的蔬菜品种起指导作用。本研究通过构建F₂分离群体,采用BSR-seq（BSA+RNA-seq）的方法对芥菜结球及叶背皮刺进行遗传分析,并对相关基因进行遗传定位。研究结果如下:1. Bju GL1调控芥菜皮刺的形成实验室前期构建了GRE102（无刺芥菜）×RT104（有刺芥菜）杂交的F₂芥菜皮刺分离群体。种植该F₂群体共132株,其中有刺植株:无刺植株=106:26。统计分析及BSR-seq的遗传分析表明该群体皮刺的有无受单一位点控制。该皮刺控制基因初定位于B02染色体54.76-58.54 Mb之间。随后利用2222株F₂个体进行精细定位,最终将其定位在117 Kb的范围内。通过与拟南芥基因组的共线性分析,在该区域找到一个与表皮毛发育相关的基因Bju GL1。目的基因克隆结果表明该基因的三号外显子上存在一个SNP,导致编码氨基酸极性的改变,启动子区域也存在DNA序列差异。在该基因上设计特异性引物进行半定量分析,结果显示其在有刺亲本中表达而无刺亲本中不表达。2. 芥菜结球相关位点遗传分析通过散叶芥菜SON101与结球芥菜LF101杂交构建F₂分离群体,利用BSR-seq方法对该群体中结球性状进行遗传分析,获得3个结球性状控制位点,分别位于B04、B05、B08染色体上。分子标记筛选3个位点中单一位点杂合、其余两个位点纯合的植株,自交后获得结球性分离的亚群体。在17个F_3:4亚群体中,仅发现染色体B04上的结球位点为杂合的两个群体仍存在明显的结球分离,该位点可能存在控制芥菜结球的一个重要基因。根据SNP-index散点图起峰的位置及该区域内SNP的delta值的分布,猜测该基因可能存在B04染色体18.45-22.15 Mb区域内,对其中的差异表达基因进行功能注释,挑选出3个亲本间存在DNA序列差异的基因:MYB47、CDPK1和APC8作为控制芥菜结球性的候选基因。本研究对芥菜皮刺的遗传分析结果可用于指导无刺芥菜的育种并为细胞命运研究提供新的材料;对芥菜结球性的遗传分析为芥菜结球基因的遗传克隆及机理分析奠定了基础,对培育具有优良结球性的蔬菜作物具有一定的参考价值。