21世纪以来，国内外各种重大财务舞弊丑闻频繁爆发，特别是2008年由“雷曼兄弟”破产引发的金融次贷危机，让全球资本市场深刻认识到内部控制的重要性。纵观近年来的各种财务舞弊事件，无论是国际大型企业安然的财务造假丑闻，还是国内中航油的重大财务亏损，都与公司治理效率低下和内部控制体系薄弱有关。为此，各国政府纷纷采取措施，2002年，美国国会通过了《公众公司会计改革与投资者保护法案》（简称“SOX法案”），此后，中国政府相关部门也联合发布了《企业内部控制基本规范》和《企业内部控制配套指引》。国内外各种法规规范的相继出台，使得内部控制缺陷问题成为研究热点，特别是SOX法案和《配套指引》对内部控制缺陷的界定和分类做了详细的规定，为内部控制缺陷研究的深入和拓展提供了有效的政策支持。我国企业现阶段在公司治理和内部控制方面存在的问题，主要表现为以下几方面：“内部人控制”现象严重，公司经营者的自利行为导致股东及其他利益相关者的利益受到不同程度的损害；治理结构的不完善导致内部控制弱化，管理层舞弊时有发生。以往的研究也表明，公司治理较为薄弱的企业往往越容易出现内部控制缺陷。为此从公司治理结构的角度出发，深入剖析内部控制失效及缺陷产生的原因，有助于从本质上认识公司治理与内部控制缺陷的关系，从而有的放矢，优化公司治理结构，提高内部控制质量。本文以深市主板A股上市公司2010-2012年的数据为研究对象，采用规范研究和实证研究相结合的方法，在文献梳理、理论回顾、逻辑机理分析的基础上构建模型，实证检验公司治理对内部控制缺陷的影响。研究结果表明：公司治理的各个方面都会在一定程度上影响内部控制缺陷的产生，其中，独立董事所占比例较大，实际控制人为政府的企业，其出现内部控制缺陷的可能性更小；而董事长与总经理两职合一，频繁召开股东大会的公司则更容易出现内部控制缺陷。这一研究结论，为我们更好地了解公司治理结构对内部控制缺陷的影响提供了参考，也为公司进一步优化治理结构，提高治理效率，保障内部控制体系的健康运行提供了方向。