小麦条锈菌cDNA文库构建和表达序列标签(ESTs)分析

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:h_f_m
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
条形柄锈菌小麦专化型Puccinia striiformis f.sp tritici引起的小麦条锈病是我国小麦生产最重要的病害之一,抗病品种的选育和合理使用是防治病害的最为有效地措施。然而由于病原菌毒性变异问题十分突出,新选育的抗病品种很快丧失抗病性,严重威胁着小麦的可持续生产。一个多世纪以来,许多研究人员从流行学、细胞学和群体生物学对禾谷类锈菌进行了深入细致的研究。但是由于锈菌是专性寄生菌,无法获得纯培养,难以建立其分子遗传操作体系,更由于小麦条锈菌缺乏有性阶段的特点,至今对其遗传变异和致病机理的认识十分有限。近年来随着分子生物学和基因组学的迅猛发展,推动了诸如条锈菌等以前难以深入研究的病原菌及其与寄主互作过程中功能基因的分析和鉴定。夏孢子萌发是锈菌发育与寄主早期互作的关键阶段,这一时期锈菌体内发生的基因表达调控和代谢活动的状况,和锈菌成功侵染小麦建立寄生关系密切相关。分析和鉴定小麦条锈菌在其夏孢子萌发这一重要发育过程中的基因表达情况,对于从分子水平认识条锈菌的阶段发育、揭示条锈菌的致病分子机理无疑具有重要价值。本研究采用SMART技术构建了小麦条锈菌夏孢子萌发特异性的cDNA文库,通过大规模EST测序、基因注释和功能分类,结合半定量RT-PCR和生物信息学方法,研究了小麦条锈菌夏孢子萌发特定时期的基因表达特征,通过研究取得了以下主要结果:1.探索并优化了小麦条锈菌Puccinia striiformis f.sp tritici 32号生理小种(CY32)大规模夏孢子萌发的适宜条件。CY32夏孢子萌发的最适温度为9℃,最适宜的孢子量是6mg/200mL水,适宜的溶液是无菌蒸馏水。2.采用SMART技术构建了小麦条锈菌CY32夏孢子萌发阶段的非均一化cDNA文库。文库的滴度为1.1×106 pfu/mL,重组率为87.5 %,文库所含独立克隆数为5.775×105个,插入片段平均长度为750bp ,文库质量符合标准要求。3.对6000个随机挑选的克隆从5’端测序,获得4798条有效EST序列,测序成功率80%。4798条有效EST序列经过质量控制和拼接后得到315个contigs和803个singletons,共1118个一致序列,451个一致序列可以在数据库中找到最佳匹配序列,其中具明确功能的有264个,187个与己知序列同源但功能未知,其余的667个没有注释信息。可以找到最佳匹配序列的表达基因在蛋白水平上大约有40.47%与丝状真菌蛋白具有同源性,39.07%与酵母具有同源性。功能已知基因按其功能分为细胞分裂与染色体结构、细胞信号与交流、细胞结构与生长、代谢、细胞防御、蛋白合成、RNA合成、转座八大类,功能未知或没有匹配序列的将其归为未分类。参与细胞信号与交流等功能
其他文献
由Blumeria graminis f. sp. tritici引起的小麦白粉病,是一种世界性真菌病害,也是我国小麦生产上发病面积最大、危害损失最重的常发性病害。其病原物小种多、变异快、侵染时期
目的:偏头痛是反复发作的搏动性头痛,也是常见病及多发病,伴恶心、呕吐、畏光、畏声等症状。偏头痛患病率女性明显高于男性,且逐年呈递增趋势,对患者的日常生活已造成了极大
“网络暴力”是一种新的社会现象,“网络暴力”下的热点事件在网络上容易引起广泛的讨论,对社会也有着一定影响。本文首先对“网络暴力”新闻报道话语方式的影响因素进行了多
2.30 无侧隙啮合方程式已知齿轮副的参数:齿数 z1、z2,模数 m,压力角α,分度圆弧齿厚 s1、s2,且 s1+s2≠p。求无侧隙啮合方程式及其名义中心距α’。设无侧隙啮合时的节圆半
建筑装饰专业作为中职学校的主要专业,为市场培养大量的建筑装饰人才,但受到传统观念的影响,使得培养出的人才缺少实践技能,影响到人才培养质量的提升。本文以建筑装饰专业为
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
目的探讨原代培养大脑皮层神经元缺氧缺血损伤后Pim1的表达及其对细胞凋亡的作用。方法取新生1日龄C57BL/6小鼠的大脑皮层神经元进行原代培养,培养第8天更换无糖无血清DMEM培
为了真实再现客家传统服饰形制,印证相关客家传统服饰文化特征研究结论的准确性,从福建省客家百岁老人张秋香的日常着装特色入手,对其服装款式、色彩、图案和服饰特征进行分析,总
随着新课改的不断推进,我国各大高校在开展课程教学时以创新教育作为基本的标准,对于环境监测课程教学而言,同样需要基于创新教育理念进行课程教学的改革。~([1])在当下的社会发展状态下,生态环境的意义已经被大家所认识,因此,环境监测有着十分重要的作用。为了进一步培养环境监测相关人才,提升其综合素质,需要进行课程教学改革,满足国家和社会对于环境监测的需求。基于此,本文将对创新教育下环境监测课程教学改革进
传统理论体系中所认为的信息传播类型包括人内传播、人际传播、群体传播、组织传播和大众传播五种,然而自从十九世纪以来发展至今,大众传播媒体越发呈现出多元化发展趋势,新