自党的十八届三中全会和五中全会不断对自然资源提出离任审计和绿色环保发展的要求后,十九大又再一次提出了我们国家要建设人与自然和谐共生的现代化,对生态文明建设和绿色发展提出要求,2018年召开的全国生态环境保护大会又再次强调了生态环境建设的重要性。污染防治攻坚战是我国面临的生态环境建设关键期,国家不断在环保方面投入巨大资金,审计作为国家治理监督的重要手段,应当发挥其独有的作用,对我国环保治理工作进行审计和评价。本文首先以政府环境绩效审计为基础,研究环境绩效审计的定义和特征,从而对水资源绩效审计进行初步的认识,加强对水资源保护绩效审计的概念、目标、特点进行界定,再以五大发展理念、生态环境资源理论、新公共管理理论、可持续发展为主要理论基础,作为对后续水资源保护绩效审计案例研究、评价的切入点。本文分析了我国开展水资源保护工作的各大阶段具体措施以及保护结果,通过对水利部各项公告进行查阅,收集了我国水资源目前的最新情况、供水能力以及水资源质量的详细资料,对我国水资源现状进行了评价,可以看出我国仍旧是缺水大国,水资源保护工作刻不容缓;紧接着文章对国家开展的水资源绩效审计工作进行了统计分析,大致分为三个阶段,然后对这三个阶段的具体审计工作进行了总结,最后对水资源保护绩效审计工作进行了简单的评价。本文采用案例研究法,对江苏省供水及环境治理项目的开展背景、前期筹划、开展过程以及成效进行了研究,并对审计范围和评价标准进行了详细的阐述,通过对项目历年来资金使用情况和项目完成比进行统计计算,对项目的完成情况进行了评价。通过对审计过程中发现的一系列违规、管理、绩效和后续整改问题进行分析,针对此次绩效审计总结了其不足之处。本文通过上述理论和案例的研究,对水资源保护绩效审计提出了五个改进建议,分别对审计范围扩大、改进评价标准、完善指标体系、审计目标调整、国外最新水资源保护机制等方面提出了具体建议。最后,结论部分对目前国家水资源绩效审计方面存在专业知识缺乏,人力不足,工作开展时间有限等问题进行总结,希望随着海量数据和网络技术的成熟,国家审计部门可以尝试开发新的审计模式,对水资源保护绩效审计工作进行改进,帮助各级部门开展水资源保护工作后的效果达到国家和社会民众的预期。同时也对未来审计部门介入环境审计领域后,助力国家绿色经济发展和生态环境建设提出美好畅想。