阿坝藏族羌族自治州（以下简称“阿坝州”）基本属于全民信教区域，该情况在相对偏远落后的阿坝县、若尔盖县、壤塘县等地尤为突出，因而藏传佛教活佛在草地僧俗中占有崇高地位，流亡境外的第十四世达赖喇嘛、格尔底活佛在部分僧俗中具有较大影响力。2008年汶川地震后，进入阿坝州活动的境外非政府组织逐年增多，加之阿坝州整体经济发展相对滞后、科教文卫事业相对落后，境外敌对势力依托境外非政府组织，假借“保护环境”、“母语保护”、“非暴力不合作”等名义进行渗透。
　　长期以来，个别境外非政府组织在以美国为首的西方霸权国家对外意识形态渗透领域中扮演了重要角色，直接或者间接的导致了目标国的“颜色革命”。我们不能否认的是大部分境外非政府组织开展的都是正常的交流合作，在一定程度上对阿坝州经济社会发展、对外交流合作发挥了积极作用，但不乏有极个别“别有用心”的组织。因此，在反分裂、反渗透工作态势严峻的背景下，结合2016年4月28日第十二届全国人民代表大会常务委员会第二十次会议通过的《中华人民共和国境外非政府组织境内活动管理法》（以下简称《管理法》），笔者认为可以在一定程度上鼓励境外非政府组织在阿坝州的活动，但同时也要十分警惕部分“别由用心”的组织，因而就更需要针对境外非政府组织在境内的活动开展相关研究。
　　本文绪论部分阐述了该课题的研究意义、国内外研究成果，并简要提及了研究的思路及办法；第二章对境外非政府组织的界定展开阐述以及就颜色革命的兴起、产生原因、危害及他国做法等背景情况展开介绍；第三章着重介绍了境外非政府组织在阿坝州发展的原因及举例在阿坝州发展的3个境外非政府组织(由于涉密原因，笔者隐去了非政府组织名称)，并分析了它们的活动特点，以及对阿坝州的积极和消极影响；第四章就《管理法》颁布后阿坝州对境外非政府组织的管理变化及存在问题做出阐述；第五章则以问题为导向，结合《管理法》和阿坝州社情，提出了一些笔者对于境外非政府组织管理的思考及建议。