嗜酸氧化亚铁硫杆菌中金属抗性相关基因的克隆及转录表达差异性研究

来源 :中南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pudding_dophin
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在Acidithiobacillus ferrooxidans(A.ferrooxidans) ATCC23270的全基因组中许多基因被注释为金属转运体或结合蛋白,本文选取六个与金属转运和结合相关的基因(afe_0654,afe_0671,afe_0674,afe_1143,afe_1144和afe_2126),研究它们在Mn2+,Zn2+和Cd2+刺激下mRNA的转录水平,为研究A.ferrooxidans耐受高浓度金属离子的分子机制奠定基础。   克隆实验表明目标基因存在于A.ferrooxidans DC中,测序及比对结果表明A.ferrooxidans DC中六个基因的序列与A.ferrooxidansATCC23270对应的基因的序列一致。生物信息学分析表明afe_0654编码重金属结合蛋白;afe_0671和afe_1144编码属于CzcA家族的十二次跨膜的重金属外排泵蛋白;afe_0674编码重金属外排系统蛋白;afe_1143编码位于细胞质膜外侧的重金属外排转运体;afe_2126编码位于细胞膜上的跨膜十一次的属于金属转运体蛋白,属于二价阳离子转运体蛋白NRAMP(natural resistance-associated macrophage protein)家族。细菌中CzcA是复合物CzcCBA的组分,化学渗透复合物CzcCBA是由CzcC(小的外膜蛋白),CzcB(连接CzcA与CzcC形成一个连续的从细胞质到胞外的通道的周质耦合蛋白)和CzcA(一个大的内膜蛋白)组成一个内外膜通道。另外,作为离子/质子交换载体外排Cd2+,Zn2+和Co2+的CzcCBA复合物是金属抗性家族RND(for Resistance, Nodulation and Division)的成员。   A.ferrooxidans DC对Mn2+,Zn2+和Cd2+的最大耐受浓度的测定。耐受实验表明在亚铁作为能源物质时A.ferrooxidans DC对Mn2+,Zn2+和Cd2+的最大耐受浓度分别是0.52,0.42和0.16 mol/L。硫粉作为能源物质时A.ferrooxidans DC对Mn2+,Zn2+和Cd2+的最大耐受浓度分别0.38,0.14和0.08mol/L。耐受实验表明亚铁作为能源物质时A.ferrooxidans DC耐受更高浓度的金属离子。三种金属离子对A.ferrooxidans DC的毒性依次是Cd2+>Zn2+>Mn2+。   实验中采用real-time quantitative PCR(RT-qPCR)来研究A.ferrooxidans DC在Mn2+,Zn2+和Cd2+刺激下目标基因的差异性表达。结果显示在Mn2+刺激下亚铁作为能源物质时目标基因均上调。在Zn2+刺激下亚铁作为能源物质时afe_0654和afe_0674下调,其余基因上调;以硫粉作为能源物质时目标基因均上调。在Cd2+刺激下afe_2126下调,其余基因上调。根据RT-qPCR的结果我们推测afe_0671,afe_1143,afe_1144和afe_2126编码的蛋白与Mn2+,Zn2+和Cd2+的转运密切相关。afe_0654和afe_0674编码的蛋白与Mn2+和Cd2+的转运密切相关,与Zn2+的转运是否相关有待进一步验证。
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