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草鱼(Ctenopharyngodon idellus)是我国最主要淡水养殖对象，其产量一直位居我国和世界养殖鱼类第一。在养殖过程中草鱼病害频繁发生，各种传染性疾病的暴发每年都给草鱼养殖业带来了巨大的经济损失。开展草鱼免疫相关基因的功能研究，阐明其与抗病力的相关性，将为草鱼抗病分子育种提供重要的理论基础。本研究拟从克隆获得的草鱼补体Bf/C2、C6和C7基因入手，对其进行结构、连锁和组织表达分析，初步了解其生物学功能，并检测它们内部的基因多态性，进行不同基因型或单倍型与草鱼细菌性败血症的关联分析，以期筛选出有育种指导价值的优势基因型，取得的结果如下：1.草鱼4个补体基因的克隆与表达根据EST拼接成的连接群或斑马鱼的cDNA序列设计引物，从草鱼基因组中克隆到补体Bf/C2A、Bf/C2B、C6、C7基因的部分序列。采用RACE方法获得了4个补体基因的cDNA全长序列，并推导出相应的氨基酸序列，与其它物种的相同基因序列进行了比较分析。这4个基因cDNA序列已提交到GenBank数据库，登录号分别为JF47038，JF47039，HQ416903，JN655169。采用Real-time PCR技术检测了补体Bf/C2A、Bf/C2B、C6、C7基因在健康草鱼成体组织、诱导后不同时点组织和不同发育时期的表达情况。结果显示，补体Bf/C2A、Bf/C2B、C6基因在所检测的12个组织中都有所表达，其中肝和脾中的表达量最高，但C7只有在头肾、中肾、皮肤、脾、心脏和肠中进行了表达。经福尔马林灭活嗜水气单胞菌诱导后，Bf/C2A、Bf/C2B、C6、C7基因在所检测的组织中出现了显著上调。补体C6mRNA在未受精的卵中转录。孵化1d C6mRNA转录显著上升，到第10d又开始下降，这表明补体C6在草鱼胚胎和鱼苗早期起到免疫保护的作用。2.草鱼补体C6、C7基因的连锁分析对补体C6、C7基因在作图家系4个亲本中进行多态性位点筛选，在补体C6基因第4号外显子上获得了1个SNP位点，在补体C7基因第5号内含子上发现了1个SNP位点。将这两个位点在两个作图家系192个子代中进行了基因分型，通过连锁分析发现补体C6、C7基因都位于草鱼第3号连锁群上，而且彼此紧密连锁，分布在微卫星标记CID0050和CID0190之间。3.草鱼补体C6、C7基因的多态性与细菌性败血症的关联分析采用人工感染嗜水气单胞菌的方法，建立了草鱼易感群体(186尾)和抗病群体(191尾)，用于连锁分析。使用基因组步移法获得了补体C6、C7基因的启动子序列，分别为1130bp和1107bp。使用PCR方法获得了补体C6、C7基因组DNA全长分别为9288bp和7068bp，都包括18个外显子和17个内含子。在草鱼C6基因中共发现了9个潜在的SNPs位点，其中编码区的1个同义突变位点，其余8个都分布在内含子上。对其中的8个位点在易感群体和抗病群体中进行了等位基因频率检测，没有发现单个SNP位点与败血症抗性有关联。连锁不平衡分析表明，其中G2638A、G2804C、A3519C、T3591C4个位点之间处于高度连锁状态(r2>80)。单倍型分析显示，共发现了13个单倍型，其中单倍型GCCC与细菌性败血症易感性显著相关(p <0.05，OR=1.45)。在草鱼C7基因中共发现了7个潜在的SNPs位点，其中编码区的1个同义突变位点，启动子区1个突变位点，其余5个都分布在不同内含子上。对其中的6个位点在易感群体和抗病群体中进行了等位基因频率检测，发现SNP位点C1931T与败血症抗性显著相关(p=0.045和p=0.028)。连锁不平衡分析表明，其中A-69C、T819C、A2456T3个位点之间处于高度连锁状态(r2>85)。单倍型分析显示，共发现了8个单倍型，没有发现单倍型与细菌性败血症显著相关(p>0.05)。