为解决粮食问题,我国致力于提高基本农田的质量,提升基本农田的综合生产能力,建立基本农田保护区,保护我国基本农田的数量与质量。同时,农户作为基本农田保护的重要主体,他们的行为意愿影响着基本农田保护的效果。本文选择乌鲁木齐市米东区作为研究区,三道坝镇和长山子镇为样本点发放政府访谈问卷及农户调查问卷,对农户的调查问卷共发放250份,收回248份,有效问卷245份。研究基于乌鲁木齐市米东区的土地利用现状、耕地情况、以及基本农田情况对政府访谈问卷及农户调查问卷所得的数据信息进行分析。通过数据分析米东区政府基本农田管理的影响因素,通过设置因变量Y为农户参与基本农田保护的意愿,利用Logistic模型进行二元回归方程计算影响因素。针对政府访谈问卷及农户调查问卷发现基本农田整体质量欠佳,基本农田基础工作有待改进,种地成本高、收益低,农户对基本农田及相关政策不了解,农户对参与基本农田监督管理积极性不高,政府对基本农田保护投入不多等基本农田管护中存在的问题。对问题的成因进行分析,得出地理位置及气候因素影响,历史原因,生产成本高农产品价格低,缺乏对基本农田及相关政策的宣传,农户意愿不受重视,信息渠道不畅,补偿资金来源不稳定等成因。以此为依据提出对策建议:政府应合理规划改善基本农田环境,改进基本农田管理基础工作,加大对农户的补贴,加大对基本农田保护的宣传,加大投资合理引导社会资本投资,重视农户意愿,建立完善的农户监督渠道;农户应积极参与宣传,配合政府工作。