迄今为止，中国国有企业改革的历程可概括为一部制度变迁、创新史。制度变迁、创新的目标是把国有企业从政府行政机构附属物转变为自主经营、自负盈亏的市场主体，因此这个变革涉及到国家、企业、员工之间的利益及权利。基于国有企业制度创新的重要性，我们认为，国有企业制度创新的顺利进行必须以伦理理念为指导。本文立足于这种认识，从伦理的角度透视国有企业制度创新引发的问题及产生这些问题的伦理根源，并针对这些问题提出了国有企业制度创新的道德选择。道德选择是一种价值取向，是为了达到某一道德目的而做出的取舍。国有企业制度创新的道德目标就是要提高企业的经济效益，以实现人的自由而全面的发展。为了达到这一目标，国有企业在制度创新的过程中，必须做出各种道德选择。坚持新制度与善指标的统一，即创新的制度不能仅仅以“新”为指标，还必须以“善”为指标，否则，“新”的可能还是“恶”的；坚持物的扩张与人的发展的统一，即企业不仅要追求物质财富的增加，还要注重企业员工的发展；坚持利的追求与义的制衡的统一，即企业之利的追求应有一个前提条件，那就是“不侵害他人的权益”，国有企业的任何取利行为都必须受到道德规范的制约；坚持权的明晰与责的承担的统一，即国有企业高层管理者手中的经营性产权、决策权以及职工选择权等必须明确，同时承担对政府、对社会、对员工的责任，确保权责利对称，防止国有企业高层管理者利用手中的特权为自己谋取私利。这些都是国有企业制度创新的明智的道德选择。只有这样，新制度才有存在的合理性，才能保证国有企业制度创新的正确方向。文章最后阐明了保障国有企业制度创新之道德性的措施，目的是为国有企业制度创新提供一个舒适、宽松的伦理环境。