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低温是植物生长过程中可能会遇到的主要非生物胁迫之一。低温会影响植株正常生长,严重时甚至影响产量。在生产生活中,秋作马铃薯和早春马铃薯则时常会受到低温的影响,甚至会导致产量降低。选育并推广耐寒性马铃薯具有重大的战略性意义。本试验通过构建马铃薯抗寒性差异群体,运用简化基因组测序技术筛选SNP多态性标签,并对所选标记进行功能验证,主要研究结果如下：1、运用一种以耐寒材料作对照,梯度变温处理、聚类分析马铃薯资源耐寒性鉴定方法。对从马铃薯工程技术研究中心收集的材料选取,包括中薯3号、兴佳2号、费乌瑞它、BS214、AV9、BS226、S4、Q304、原始栽培种Yan2以及野生种GS393(S.commersonii-LZ3.4)及S.commersonii和普通栽培种的原生质体融合所得植株的F1代等共计54份材料进行抗寒性鉴定,获得由15份抗寒性差异性状突出的核心资源组成的群体。2、构建抗寒性相关的EST库。在NCBI上输入关键词cold、potato、tomato、rice等,查询低温应答相关序列,筛选其中与抗寒性关系较大的序列下载,建立三个fasta文件,共计8739条DNA序列,成功构建EST库。利用Blast应用程序BLASTEN 2.2.25版本进行马铃薯抗寒性状相关功能的SNP标记的比对与筛选。以identity 80%为标准,获得比对效果较好的SNP位点428(土豆EST)+4(水稻EST)。这些位点可以做为抗寒性状的SNP候选位点。3、筛选到1个马铃薯抗寒性相关的SNP标记。将EST库比对得出的SNP候选位点与核心资源差异群体的生物学表型(半致死温度)进行相关性分析,得到25个SNP候选位点。根据SNP位点所在序列设计引物,提取差异群体的DNA,通过PCR进行特异性DNA片段扩增、TA克隆测序,所得结果与原高通量测序结果进行比对分析,找到了与马铃薯抗寒性相关的SNP标记1个,命名为S-6-0620。通过大群体验证后确定为是与马铃薯抗寒性状相关的SNP位点。