论文部分内容阅读
目的:研究补体受体1 (complement receptor 1, CR1)基因的单核甘酸多态性(SNP)位点rs3811381和rs2274567在广西人群中的分布;探讨rs3811381和rs2274567两个SNP位点与HBV背景下慢性肝炎、肝硬化、肝癌患病风险之间的关联,获得有意义的SNP位点和基因,为广西地区HBV感染相关肝病的防治提供新的遗传标记和生物靶点。方法:采用病例对照的研究方法,以227例随机健康体检人群作为对照组,纳入HBV相关性肝炎100例、肝硬化71例、原发性肝癌228例。应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)技术和聚酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测CR1基因rs3811381和rs2274567两个位点单核苷酸多态性的分布,同时进行DNA直接测序验证,直接计数法得到两位点各组基因型和等位基因频率。应用拟合优度χ2检验对CR1基因两个位点进行哈-温平衡检测,并采用Logistic回归分析校正性别、年龄、饮酒史、吸烟史和民族等混杂因素,计算OR值及95%CI,分析两位点与患病风险间的关联。采用SHEsis软件构建CR1基因两个位点的单倍体型。结果:1.CR1基因rs3811381和rs2274567两个位点中,除了两位点对照组(p<0.05)外,其余各组基因型的频率分布均符合HWE (p>0.05)。2.CR1基因rs3811381位点有CC、CG、GG三种基因型。Logistic回归分析校正性别、年龄、吸烟史、饮酒史及民族混杂因素后,以CC基因型为参照,CG和GG基因型均未发现与各病例组的发病风险有关(p>0.05)。以C等位基因为参照时,G等位基因与各病例组的发病风险亦无相关性。3.CR1基因rs2274567位点有AA、AG、GG三种基因型。Logistic回归分析校正性别、年龄、吸烟史、饮酒史及民族混杂因素后,以AA基因型为参照,AG和GG基因型均未发现与各病例组的发病风险有关(p>0.05)。以A等位基因为参照时,G等位基因与各病例组的发病风险亦无相关性。4.对性别分层后,发现CR1基因rs3811381位点的G等位基因可增加广西女性人群HBV背景下肝硬化患病风险(p=0.024, OR=2.913,95%CI=1.153-7.363); CR1基因rs2274567位点的GG基因型可增加广西男性人群HBV背景下肝癌患病风险(p=0.043, OR=1.793,95%CI=1.019-3.154)。5.对年龄分层后,发现在≥50岁人群中,CR1基因rs3811381位点的GG基因型可增加HCC的患病风险(p=0.017, OR=2.912, 95%CI=1.214-6.983);在<50岁人群中,CR1基因rs3811381位点的CG基因型和G等位基因可降低HCC的患病风险(p=0.037, OR=0.436,95%CI=0.199-0.952;p=0.019, OR=0.612,95%CI=0.406-0.923);而CR1基因rs2274567位点对年龄分层后,发现其基因型和等位基因与CHB、LC以及HCC患病风险均无关。6.对饮酒史分层后,发现在有饮酒史人群和无饮酒史人群中,CR1基因rs3811381和rs2274567两位点基因型和等位基因与CHB、 LC及HCC患病风险均无关。7.对吸烟史分层后,发现在吸烟人群和不吸烟人群中,CR1基因rs3811381和rs2274567两位点基因型和等位基因与CHB、LC及HCC患病风险均无关。8.对民族分层后,发现在壮族和汉族人群中,CR1基因rs3811381和rs2274567两位点基因型和等位基因与CHB、LC及HCC患病风险均无关。9.在对照组与各病例组构建rs3811381和rs2274567两位点单倍体型,共得到AC和GG两种单倍体分析结果,均未发现有意义的单倍体型。结论:1.CR1基因rs3811381位点的G等位基因可能是广西女性人群HBV背景下肝硬化患病的危险因素。2.CR1基因rs2274567位点的GG基因型可能是广西男性人群HBV背景下肝癌患病的危险基因。3.CR1基因rs3811381位点的GG基因型可能是广西年龄≥50岁人群HBV背景下肝癌患病的危险基因。4.CR1基因rs3811381位点的CG基因型和G等位基因基因可能是广西年龄<50岁人群HBV背景下肝癌患病的保护因素。