红麻种质资源对象耳豆根结线虫的抗性鉴定与转录组解析

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象耳豆根结线虫(Meloidogyne enterolobii),是1983年杨宝君在象耳豆树上发现的1个根结线虫新种,较常见的四种根结线虫来说,具有更强的毒性,更强的适应性,能克服Mi基因的抗性,其寄主范围也在不断更新。海南岛的瓜果蔬菜、我国的麻类主产区正在受到该种线虫的严重危害,然而象耳豆根结线虫的抗性材料匮乏。本研究在此基础上,对我国220份红麻种质资源进行了田间抗病性和大棚盆栽抗性鉴定试验,并根据室内组织病理学观察结果,完成了根结线虫在12个不同侵染时期的转录组测序,每个样品测序产出不少于6Gb Clean Data,Q30碱基百分比达到85%。完成Unigene的拼接和功能注释,并进行Unigene的SSR分析、表达定量、差异分析和功能富集分析。主要结果如下:(1)综合盆栽和大田抗性鉴定结果,共筛选到62份高抗种质材料,41份高感材料。(2)对代表性的高抗、高感种质资源的盆栽接种试验结果表明,象耳豆根结线虫在接种后18h时,侵染量最大,此结果在高抗、高感材料中表现一致。(3)对关键时期的转录组结果分析表明,共获得81.95Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到6.12Gb,Q30碱基百分比在89.69%及以上。组装后共获得125,949 条 Unigene。其中长度在 lkb 以上的 Unigene 有 38,231 条。对 Unigene进行功能注释,包括与 NR、Swiss-Prot、KEGG、COG、KOG、GO 和 Pfam 数据库的比对,共获得82,499条Unigene的注释结果。进行基于Unigene库的基因结构分析,其中SSR分析共获得17,622个SSR标记。进行基因在各样品中的表达量分析。基于基因在不同样品中的表达量,识别差异表达基因。对差异表达基因进行模式聚类、功能注释以及富集性分析。(4)KEGG通路富集分析表明,感、抗红麻种质差异表达显著基因主要分布于植物-病原互作、植物激素信号转导、过氧化物和RNA转运等通路中,上调表达的基因有 BAK1、WRKY33、LAA、AHP、ARR-A、PP2C、SnRK2、BAK1、CYCD3、TGASOD、PDCRRNase2、Exp5、eEF1A、eIF3、eIF2B、ACIN1、PABP,下调表达的基因有 RBOH、ARF、EIN2、ATG1、ATG10、MPV17、HAO2、Um、eIF4E、gp210、UBC9 和 THOC5。
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