【摘 要】
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MicroRNA （miRNA）是一种内源性的小分子RNA,长度约为21-25个核苷酸大小。miRNA不仅调控植物的生长发育,还在多种逆境胁迫下发挥重要的调控作用。灰杨（Populus pruinosa）是我国西北干旱盐碱的荒漠和戈壁地带形成森林的高大乔木树种之一,已经成为研究树木抗性的模式植物。该物种经过长时间的自然选择,使其成为各种抗逆能力（抗旱、抗高温、抗盐碱等）均为最高的木本植物之一。本研
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MicroRNA （miRNA）是一种内源性的小分子RNA,长度约为21-25个核苷酸大小。miRNA不仅调控植物的生长发育,还在多种逆境胁迫下发挥重要的调控作用。灰杨（Populus pruinosa）是我国西北干旱盐碱的荒漠和戈壁地带形成森林的高大乔木树种之一,已经成为研究树木抗性的模式植物。该物种经过长时间的自然选择,使其成为各种抗逆能力（抗旱、抗高温、抗盐碱等）均为最高的木本植物之一。本研究以灰杨正常和盐胁迫的愈伤组织为材料,应用第二代高通量测序技术对灰杨的miRNA进行系统的挖掘与鉴定；在此基础上通过生物信息分析,识别灰杨的抗盐相关miRNA基因以及miRNA参与的抗盐调控机制。本研究主要获得了如下结果： （1）通过构建正常愈伤组织和盐胁迫愈伤组织两个测序文库,分别得到了22,777,692和21,611,778条测序Reads,对这些Reads进行注释鉴定出129个保守miRNA和38个新miRNA基因。（2）通过差异表达分析,发现盐胁迫下有25个miRNA的表达量发生了显著改变,其中15个上调,10个下调。（3）对miRNA进行靶基因预测,发现具有显著差异表达的miRNA主要调控离子交换功能与转录因子功能相关的基因,如：植物生长素应答因子（ARF）、漆酶（laccase）家族基因等。（4）检测到了85个与miRNA成熟序列相互补的miRNA*链,其中有9个保守miRNA*的表达量高于其miRNA成熟端的表达量。（5）为了更进一步分析1miRNA与其靶基因间的调控模式,我们对正常和盐胁迫的愈伤组织进行了相应的转录组测序,得到了盐胁迫下miRNA靶基因的表达谱。 本研究不但扩充和完善了杨属植物的miRNA数据,识别的与抗盐相关的miRNA还能够为植物特别是林木miRNA盐胁迫应答相关研究提供非常有用的信息。此外,通过联合分析相同处理条件下的转录组与miRNA数据,为研究miRNA与其靶基因调控模式进行了新的探索。
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