蛋白质亲缘关系网络的构建与基于TSPL算法的图像去噪研究

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拓扑蛋白质组学是蛋白质组学一个崭新的研究方向。MELK技术是拓扑蛋白质组学中的关键技术。多肌炎是自身免疫性结缔组织疾病,特点是肌组织出现炎症导致对称性肌无力和一定程度的肌萎缩。为了考察多肌炎症状下T细胞表面不同的粘合机制,我们选取T细胞入侵过程中15种T细胞表面受体蛋白的MELK受体组合模式(Combinatorial Receptor Patterns)数据做进一步研究。构建了两类蛋白质亲缘关系网络:一类是基于MELK受体组合模式数据,采用McNemar’s检验法来评估该数据构建的MELK亲缘关系网络,另一类是基于GO数据,采用蛋白质对RSS值构建的GO亲缘关系网络。最后采用子集奇异性(SubsetSurprisology)理论评价两个网络的相似度。评价结果表明两个网络是高度相似的。该结论验证了MELK技术的可靠性并扩展了其应用范围。椒盐噪声是数字图像处理领域中一种重要的噪声模型。为了实现椒盐噪声的有效去除和图像细节的有效保留,在基于三子集划分的灰度图像分层表示算法(TSPL算法)的基础上,结合数学形态学,提出一种图像去噪新方法。该方法利用形态学闭运算算子处理TSPL算法生成的分层图像。模拟实验结果表明,本文提出的去噪新方法在主观视觉上可达到与中值滤波图像同样清晰的效果,但在均方误差、信噪比和峰值信噪比等客观评价指标上相对于中值滤波图像都有显著改善。故在去除图像椒盐噪声上优于传统的中值滤波等方法。
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