非编码RNA与妇科恶性肿瘤的临床病理特征及发生发展的初步机制研究

来源 :新疆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:laoyoutiao66
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目的:本研究的目的在于研究以HOTAIR、miR-17-5p及miR150为代表的两类非编码RNA(microRNA与长链非编码RNA)在宫颈癌发生发展及卵巢癌耐药过程中的表达情况,结合临床病理特征探讨这三个非编码RNA在宫颈癌发病及卵巢癌肿瘤耐药中的分子机制,探索其对宫颈癌患者及卵巢癌患者早期筛查、早期诊断及治疗的价值。方法:(1)收集2014年7月~2015年9月新疆医科大学第一附属医院妇科和门诊就诊的女性病例9例,通过高通量测序技术检测宫颈癌相关的基因;(2)发现和识别宫颈癌致病过程的相关的潜在的具有差异表达的mRNA及lncRNA,建立表达谱;(3)通过生物信息预测出与宫颈癌致病相关的microRNA与卵巢癌致病相关的microRNA;(4)收集2015年3月~2016年1月新疆医科大学第一附属医院妇科和门诊就诊的女性宫颈癌及慢性宫颈炎病例50例,利用RT-PCR技术方法检测HOTAIR及miR-17-5p在不同宫颈病变内的表达,同时分析与肿瘤分期、是否有淋巴转移等病理特征的相关性;(5)用qRT-PCR、CCK8、细胞侵袭实验及细胞调亡检测技术检测miR-150与帕妥珠单抗在卵巢癌细胞耐药中的初步机制研究;(6)采用qRT-PCR、CCK8、小室侵袭实验对HOTAIR进行功能性研究。结果:一 基于高通量测序技术及生物信息预测的宫颈癌及卵巢癌相关非编码RNA的筛选 1.本研究通过RNA-Seq技术对潜在的与宫颈癌发病相关的癌基因进行了收集和分析,通过9例样本研究共筛选出约28518个基因,癌变和病变样本中共同的显著上调表达mRNA为 220个,共同的显著下调表达mRNA为 161个。检测所得的差异 lncRNAs有6060个,其中呈异常高表达状态的lncRNAs有683个,呈异常低表达状态的lncRNAs有781个。2.探究并识别与宫颈癌生存率相关,能够反映预后转归的潜在lncRNA,并结合数据库,对结果进行了验证,综合对比、评定各个相关指标,从诸多潜在1ncRNAs中找到与宫颈癌发病、预后紧密相关的HOTAIR,并对其展开深入研究。3.发现和识别预后生存标志物miRNA生物信息学预测,结合相关文献的浏览找到受已知的 miRNA调控的差异表达的基因,筛选出与宫颈癌发生发展相关的miR-17-5p,以及卵巢癌耐药相关的miR-150。二 HOTAIR、miRNA-17-5p在宫颈癌组织的表达及miRNA-150在卵巢癌细胞耐药机制的初步探讨1.miR-17-5p在宫颈癌组织中低表达,在新疆维吾尔族和汉族妇女间表达无种族差异。而HOTAIR在宫颈癌组织中高表达,在新疆维吾尔族和汉族妇女间表达无种族差异。Spearman秩相关性分析显示两基因表达呈负相关。2.miR-17-5p的低表达以及HOTAIR的高表达都同宫颈癌FIGO分期和淋巴结转移显存在密切的联系。同时,miR-17-5p的低表达同宫颈癌组织分化的状况存在密切的关系。HOTAIR的高表达同宫颈癌肿瘤直径多少有关。两基因的表达都同年龄,肌层浸润以及宫旁浸润没有直接的联系。3.我们对卵巢癌和SNU119细胞系用不同浓度帕妥珠单抗干预24小时后,实时荧光定量PCR分析miRNA-150表达,发现表达均上调。抑制miRNA-150表达后后,加入帕妥珠单抗后可抑制细胞增殖。4.在帕妥珠单抗干预后SKOV3和 SUN119细胞出现G0/G1期停滞。然而,当miRNA-150下调,帕妥珠单抗诱导的G1期阻滞获救,这些结果表明,miRNA-150的下调表达可能有助于增加帕妥珠单抗对卵巢癌细胞的耐药性。三、lncRNA HOTAIR在宫颈癌细胞中的功能性研究 1.我们对比HOTAIR在人宫颈癌细胞系和对照组内的表达状况,得知其在人宫颈癌细胞株Siha和Caski内表达显著增加。2 我们下调了HOTAIR的表达,构建了稳定低表达HOTAIR的细胞株及其阴性对照用于体外的验证实验。其同阴性对照和亲本细胞相比,下调HOTAIR表达能够明显抑制宫颈癌细胞株Siha以及Caski细胞的增殖及侵袭能力。结论:1.通过高通量测序技术,发现在宫颈癌发生发展过程中存在异常表达的长链非编码RNA集合,通过生物信息学预测、发现和识别于宫颈癌及卵巢癌相关的标志物miRNA17-5p及miRNA150。2.miR-17-5p以及HOTAIR的表达都同宫颈癌FIGO分期和淋巴结转移显存在密切的联系,且两者呈负相关,也许是彼此作用干扰宫颈癌的演变。检测两个目标基因的表达于诊断宫颈癌等临床病理指标内存在一定的现实意义。3.本研究结果表明非编码RNA在妇科肿瘤中既可以作为癌基因,又可以作为抑癌基因。本研究内HOTAIR于宫颈癌组织内表达上调,同时和肿瘤的形态及转移存在紧密的联系,miR17-5p能够视作宫颈癌预测以及判断预后的分子标志物,可其转录调控机制还需深入研究。4.miRNA-150可能参与了帕妥珠单抗诱导的肿瘤生长抑制,miRNA-150的下调表达可能是帕妥珠单抗耐药的原因。5.本研究再次证实了通过沉默HOTAIR后,宫颈癌Siha及Caski细胞增殖、侵袭和转移能力均降低,下调HOTAIR的表达能够抑制宫颈癌细胞的增殖和侵袭能力,于宫颈癌的演变内具有癌基因的功能,能够视作宫颈癌预测以及判断预后的治疗靶点,可是其具体的转录调控机制需要予以深入研究。
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