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目的本研究采用两种方法比较对外周血和组织标本检测EGFR-TKI治疗后获得性T790M基因突变情况,应用ddPCR法和ARMS法检测晚期NSCLC患者经EGFR-TKI治疗耐药后的血浆ctDNA中EGFR T790M突变状态,用ARMS法检测组织EGFR T790M突变状态,从而探讨代替组织标准可应用于患者血浆EGFR T790M突变更敏感的检测方法,并分析检测结果与患者的一般临床特征和进展后治疗及预后的相关性。方法收集2014年8月-2015年12月浙江省肿瘤医院经EGFR-TKI治疗后获得性耐药的晚期非小细胞肺癌患者108例,每位患者留取10ml全血标本,其中16例患者再次活检获取组织标本。ddPCR检测108例所有患者的血浆EGFR T790M突变状态,其中75例血浆标本同时采用ARMS法与ddPCR方法检测T790M状态。另外16例组织标本采用ARMS法检测T790M基因状态,并与血浆ddPCR方法检测结果比较。结果ddPCR法检测108例患者血浆标本结果显示获得性耐药T790M突变率为43.5%(47/108)。75例患者血浆分别进行ddPCR法与ARMS法检测T790M基因检测,其中ddPCR阳性检出率为46.7%(35/75),而ARMS法检测率是25.3%(19/75)。16例患者同时进行了组织标本ARMS法检测和血浆ddPCR法检测,阳性率分别是为56.3%(9/16)和50.0%(8/16),其中组织ARMS法T790M阴性的7例患者中,有2例患者表现为血浆T790M阳性。对于T790M突变阳性者获得性耐药肿瘤生长倾向于缓慢进展模式(40.4%),而阴性患者进展模式更倾向于快速进展(39.3%)。108例患者的中位PFS为12.3个月,其中ddPCR-T790M阳性中位PFS长于阴性的患者(13.1：10.8个月,P=0.010)；中位OS是32.8个月,T790M突变0S长于阴性患者0S(35.3：30.3个月,P=0.214)。结论使用ddPCR技术给晚期非小细胞肺癌患者血浆ctDNA中EGFR T790M基因突变状态提供一个更敏感的检测方法。在一定条件下可以替代组织标准检测,克服组织的难获取性和肿瘤组织异质性,更方便、无创、敏感的检测获得性耐药基因T790M突变的变化。对于获得性T790M突变患者较T790M阴性患者的预后更好。