云南有色金属矿山细菌多样性的非培养分析

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生物冶金技术不仅能有效地处理低品位矿石和难处理的尾矿,而且对环境友好,矿区微生物甚至能很好地用于矿山污染环境的修复。云南省是著名的“有色金属王国”,为了使微生物资源能够更好地服务于矿业领域,本实验室重点开展了有色金属矿区微生物的多样性研究。本研究样品采集于云南省三个典型的有色金属矿山—兰坪铅锌矿区、北衙金矿区和文山铝土矿区。样品采用分区多点的方法采集,样品包含矿区矿石样和土样。首先通过构建细菌16S rRNA高变区基因文库的方法分析了三个矿区细菌的多样性。文库测序结果表明矿区样品中细菌种类丰富。兰坪铅锌矿基因文库聚类为4个类群,分别是变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)。这4个类群又可以细分为27个属,分别为水栖菌属(Enhydrobacter)、 Elizabethkingia、丙酸杆菌属(Propionibacterium)等,优势菌群为变形菌门,占克隆总数的51.7%,其次是厚壁菌门,占克隆总数的25.8%;北衙金矿文库也聚类为拟杆菌、变形菌、放线菌和厚壁菌门4个类群,可细分为23个属,分别为Hymenobacter、沙雷氏菌(Serratia)、莫拉克氏菌属(Moraxella)等。优势菌群为变形菌门,占克隆总数的68.3%,其次为拟杆菌门,占克隆总数的12.5%;文山铝土矿文库包含5个类群,分别是变形菌、厚壁菌、拟杆菌门、放线菌和梭杆菌门。这5个类群可细分为25个属,分别为气单胞菌属(Aeromonas)、假单胞菌属(Pseudomonas)、志贺氏菌属(Shigella)等,变形菌门仍为优势菌群,占克隆总数的69.2%,其次是厚壁菌门,占克隆总数的20%。同时采用流式细胞术对文山铝土矿采集的6个样品进行了分析,结果发现除了3号样品不能在散点图中找到第二大优势菌群外,其余的都可以找到第二大优势菌群,散点图的分布间接证明了文山铝土矿样品中细菌多样性丰富,并显示了矿区样品中细菌群落的大致分布。研究也运用宏基因组的方法对三个矿区细菌多样性进行了分析,结果正在返回中。通过研究表明,云南省三个典型有色金属矿山—兰坪铅锌矿、北衙金矿和文山铝土矿样品中的细菌种类丰富,主要以变形菌门为主。三个矿区有其独特细菌类群,也有相同类群的细菌,其中某些类群与uncultured bacteria的相似度较高,说明三个矿区中可能都存在新的分类单元。
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