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本文通过对河南省洛阳市宜阳县、洛宁县、汝阳县和漯河市临颍县烟区根际土壤微生物数量、多样性和群落结构组成等相关指标进行检测分析,明确了不同生态因子对烟田根际土壤微生物区系的影响,为通过采取生物技术措施确保烟田土壤健康提供理论支撑。(1)烟株生长过程当中,平原与丘陵地区根际土壤可培养细菌数量>放线菌数量>真菌数量,同时可培养微生物数量均为先增加后降低、旺长期达到最大值的趋势。随着烟株生长发育的进行,根际土壤中细菌和真菌群落多样性逐渐降低,相较于移栽前旺长期和成熟期根际土壤中微生物群落结构相似度较高。平原与丘陵地区根际土壤中优势细菌种类差异较小,而优势真菌的种类和丰度均存在较大差异性。(2)旺长期和成熟期健康烟田根际土壤中可培养细菌和放线菌数量远远高于感病烟田,成熟期感病烟田中可培养真菌数量高于健康烟田。健康烟田微生物群落多样性基本大于易感病烟田,细菌和真菌群落结构在成熟期均出现了较大的差异性。成熟期健康烟田根际土壤中有益菌属相对丰度高于易感病烟田,而易感病烟田根际土壤中病原菌数量则高于健康烟田。(3)相较于烟草连作,改种玉米后能够提高根际土壤微生物的多样性。栽种前后烟田和玉米田根际土壤中门水平和属水平优势细菌种类均差异不大;栽种前后烟田和玉米田根际土壤中门水平优势真菌种类均差异不大,但栽种玉米和烟草后属水平优势真菌种类和相对丰度均发生明显变化。(4)烟株生育期内,轮作烟田根际土壤中可培养细菌和放线菌数量均高于连作烟田,而可培养真菌的数量则低于连作烟田。在烟株生长过程中轮作烟田根际土壤细菌和真菌群落多样性均高于连作烟田。在旺长期和成熟期轮作和连作烟田根际土壤微生物群落结构差异较大。轮作烟田根际土壤中属水平益生菌相对丰度均高于连作烟田,而在连作烟田根际土壤中出现的腐霉属(Pythium)病原菌,轮作烟田中并未出现。(5)随着连作年限的增加,烟田根际土壤中可培养细菌和放线菌数量逐渐减少,真菌数量逐渐增多,群落多样性逐渐降低,病原菌富集,有益微生物相对丰度降低。旺长期连作2年与连作4年、6年烟田根际土壤细菌群落结构差异性较大,移栽前和旺长期不同连作年限间真菌群落结构存在差异性。(6)通过比较健康烟田与非健康烟田根际土壤中微生物区系发现,轮作方式、种植年限以及烟田发病状况等对烟田土壤健康状况有重要影响。通过采用轮作、降低连作年限和改变施肥方式等方法均能改善烟田土壤状况。