目前,我国高校的改革和发展存在着诸多问题,总体来讲,是大学内部各方权力失衡。具体来讲则表现为：党政权责不清；行政权力泛化,学术权力弱化；教师和学生的民主权力得不到落实等等。这诸多问题反映出了我国大学内部治理结构不合理的事实,这种结构不合理不仅导致了大学内部各利益主体矛盾突出,也严重影响了学校的教学、科研、社会服务的质量。因此,如何完善现代大学治理结构,平衡各种力量,兼顾各权利主体利益,就成了高教理论界研究的一个热点问题。从现有的理论研究来看,学者们根据不同的理论,从不同的视角提出了各种策略和建议。从实践探索来看,部分高校在借鉴国外经验的基础上,进行了以实施董事会制度、教授治学制度为核心的内部治理结构改革。然而目前不管是高校进行的董事会制度还是教授治学制度改革都存在着诸多问题,如在董事会制度改革中,董事会的地位不明确、功能发生异化、权力运行缺乏法律依据等；在高校教授治学制度改革中,教授拥有的学术权力还不够,学术权力行政化现象依然存在。以上问题的存在严重影响和制约着高校内部治理结构的改革成效。笔者认为,大学内部治理结构改革是一项复杂的系统工程,其成功与否不仅取决于高校自身的改革措施是否得当,也取决于法律、教育体制是否健全以及社会环境的好坏。为此,本文在阐述了大学内部治理结构改革困境后,从政府、法律、社会及高校自身等方面入手,着重分析了高校大学内部治理结构改革面临困境的原因,并试图通过委托——代理理论、博弈论等理论以及借鉴美国大学内部治理结构的成功经验,结合我国国情、校情提出进一步完善大学内部治理的对策建议。