红掌分子图谱构建及与花色连锁分子标记筛选

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花色是观赏植物育种的主要目标性状。建立红掌分子图谱和分子标记辅助花色选择技术体系,对进一步开展红掌分子育种、缩短红掌育种周期、提高红掌育种效率具有重要意义。本研究采用Anthurium‘Mystral’和A.‘Alabama’红掌杂交构建作图群体,对A.‘Mystral’和A.‘Alabama’红掌进行转录组测序和SSR标记开发,利用SSR标记进行红掌分子图谱构建,并筛选与花色性状连锁的分子标记。主要研究结果如下:1、红掌杂交后代性状的分析及作图群体的构建。(1)A.‘Mystral’和A.‘Alabama’红掌杂交后代性状发生了明显的分离,不同性状分离程度不同,变异系数在7.6%至23.1%之间,花部性状分离程度最高,特别是佛焰苞形状,叶部性状次之;(2)杂交后代278株中,有香植株数与无香植株数比例为2∶1;(3)从268株杂交后代中选出94株作为分子图谱构建的作图群体。2、A.‘Mystral’和A.‘Alabama’红掌转录组测序和SSR标记开发。(1)对A.‘Mystral’和A.‘Alabama’红掌营养器官和生殖器官进行转录组测序,共得到79735个unigenes;(2)利用MISA软件对1 KB以上的unigenes进行SSR位点的筛选,在7655个基因序列上筛选出10625个SSR位点,含有六种核苷酸类型,以一、二和三核苷酸重复单元为主,占总SSR比例的98.38%;(3)利用Primer Premier 5.0进行引物设计,开发出299对SSR引物;随机选出24对SSR引物进行多态性分析,共获得14对引物有多态性,多态率为58.3%。3、红掌SSR分子图谱的构建。(1)利用309对SSR引物在亲本间进行多态性引物筛选,获得条带清晰、稳定性好、重复性好的引物160对;(2)利用134对引物对作图群体进行分析,共检测出183个多态性位点;(3)利用JoinMap 4.0软件对DNA带型数据进行处理,获得一张含有25条连锁群的分子图谱。该图谱总图距是1428.1 cM,平均图距为16.8 cM。4、与红掌花色连锁的分子标记筛选。根据NCBI数据库及Web of Science数据库中60个观赏植物花色基因序列,利用Primer Premier 5.0软件开发出与观赏植物花色相关的引物58对,采用这些引物对60份红掌构建的10个花色基因池进行PCR扩增,初步筛选出6个与红掌花色连锁的标记。通过上述研究,明确了A.‘Mystral’和A.‘Alabama’红掌杂交后代群体的遗传多样性,构建了红掌作图群体,开发出309个SSR标记,初步构建了红掌SSR连锁图谱,筛选出6个与红掌花色连锁的分子标记,为进一步开展红掌主要育种目标性状基因定位和分子育种奠定了基础。
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