自由裁量权广泛存在于行政和司法活动中，其使用是一柄双刃剑，在带来高效行政的同时，也带来自由裁量权的滥用问题。因此，厘清自由裁量权的客观存在意义，梳理滥用自由裁量权的问题和危害，探索合理控制自由裁量权是包括海关在内的所有行政机关必须面临的问题。在目前关于合理控制行政自由裁量权的学术研究中，人们过分强调了通过立法控制、司法控制等外部控制途径来实现对行政自由裁量权的控制，一定程度上忽视了内部控制的重要作用。相对外部控制而言，行政机关由于具有自制和向善的可能，加上其对自身权力运行的熟悉，内部控制更有针对性和实效性。同时，在中国目前强势政府的现实制度环境下，强化行政机关内部控制也是一种必然的选择和有效的策略。本文以海关为例，海关行政自由裁量权同所有的行政自由裁量权一样，是一把“双刃剑”。基于当前我国的国情和海关行政管理现实，对海关行政自由裁量权进行合理有效的控制，是一个综合的、复杂的系统工程，不仅要在立法控制和司法控制方面下功夫，更要建立一套内部控制机制。文中结合海关管理和行政执法实践，对加强海关行政自由裁量内部控制机制进行了设计，从建立完善的规范执法机制、有效的内部监督机制、科学的考核评估机制、强力的自我纠错机制、长效的队伍建设机制等方面入手，建立了一个由各种机制合理配置、相互制约、协调发展的工作系统。通过这套内部控制机制，保障海关行政自由裁量权的规范行使。本文分为三个部分：第一部分引言，综述当前行政自由裁量研究的现状及本文研究意义；第二部分对自由裁量权及行政自由裁量权的概念等问题进行探讨；第三部分对海关行政自由裁量权存在的必要性、问题及控制措施进行分析归纳；第四部分分析外部控制的局限，从规范执法机制、内部监督机制、考核评估机制、自我纠错机制、队伍建设机制等五个方面，提出建立海关行政自由裁量权的内部控制具体构想，为中国行政机关遏制行政自由裁量权滥用提供一种方法路径借鉴。