人工核酸酶—寡聚酰胺与丝组二肽缀合物的合成研究

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化学合成的DNA、RNA定位切割试剂是国际上80年代开始发展起来的一类新型的非酶断裂工具,被称为人工核酸酶或化学核酸酶。人工核酸酶是分子生物学及基因工程的重要工具,它可以作为研究核酸结构和功能方面的探针。因此开发出高效的人工核酸切割试剂,具有非常重要的理论意义和应用价值。人工核酸酶主要由识别试剂和切割试剂通过某种连接物缀合而成。 本论文设计合成出了寡聚酰胺/丝组二肽缀合物这样一类新型的人工核酸酶。它以单体N—甲基吡咯为原料,合成的寡聚酰胺作为该分子的核酸识别系统。同时,连接物(己二胺部分)与切割系统(丝组二肽部分)的组氨酸残基C端相连,这样就可以保证切割活性基团一丝氨酸残基上氨基和侧链羟基的相对位置。实验主要用到了DCC/HOBt偶合反应,Chloroform反应,Pd-C催化氢化反应,该系列的合成反应条件温和,反应时间短,除少数步骤产率较低外,大部分收率较高。 我们利用氢谱、碳谱、红外光谱、电喷雾质谱、高分辨质谱及多种二维核磁共振谱等分析手段对化合物结构进行了详细的表征,并从中总结出了一些规律,这对以后判别此类化合物提供了参考。例如,利用~1H NMR可以很方便的判断化合物中含有几个N—甲基吡咯环,利用电喷雾质谱可从化合物的断裂途径判断出各个基团的连接顺序。 同时为了保证合成的化合物在生物活性测试时的纯度,我们利用高效液相与质谱联机方式(HPLC—ESI—MS)对多步合成的寡聚酰胺/丝组二肽缀合物进行分析。与清华大学合作,初步实验发现合成的多聚酰胺/丝组二肽缀合物对DNA的切割活性高出丝组二肽数百倍。
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