自动指纹识别是基于模式识别技术，同时融合传感器技术、生物技术、电子技术、数字图像处理技术等多种核心技术于一体的综合性技术。随着新型指纹传感器的不断提出，嵌入式微处理器性能的不断提高，安全性好、体积小、可靠性高的嵌入式指纹识别系统成为可能，并在智能IC卡、手机、PDA、汽车安全等领域有着广泛的应用前景。 本文基于ARM9处理器和嵌入式Linux操作系统，提出了一套嵌入式自动指纹识别系统的设计和实现方法。本文首先介绍了嵌入式Linux操作系统结构以及如何建立嵌入式Linux操作系统开发、调试环境。并给出了嵌入式Linux内核配置裁剪和一种嵌入式Linux环境下显示驱动开发、调试的方法，同时在显示驱动基础上进行了图形界面GUIEmbeddedQT的交叉编译和移植。此外本文针对所选择处理器和指纹传感器图像的特点，分析图像预处理，特征提取，特征匹配的一些方法，设计出了一套较为有效的嵌入式指纹识别算法。该算法首先利用小块图像的方差来进行切分，运用方向图来对灰度图像进行方向滤波，然后采用一种模板匹配细化算法，提取出高质量的指纹骨架纹线。本文提出的细化后处理方法，能够有效的去除由短线、脊线断裂、毛刺等原因产生的大部分伪特征点。经过预处理的各个阶段，最终可以精确地提取特征点的类型、坐标和方向，存储成指纹模板。基于特征点的两副指纹的匹配实质是两张点模式图的匹配，本文运用一种基于点模式的匹配算法，该算法在系统中计算量小、运算时间短，适合于嵌入式系统的要求。最后本文针对嵌入式系统的特点对算法的代码进行了一定优化，并选择了嵌入式系统下编译器的优化选项，系统经过测试体现出了良好的精度和速度，且人机交互界面友好。