大豆作为重要的粮食作物含有很多有益人体的营养物质,在中国农业方面占据着重要的地位。目前大豆需求逐渐增加诱使大豆连作危害日益凸显,连作是由土壤微生物、根际土壤和作物共同的作用结果,连作种植抑制作物生长主要通过土壤环境劣变、植物自毒现象和土壤微生物群落破坏等方面所致。近年来丛枝菌根真菌（Arbuscular Mycorrhizal Fungi,AM真菌）在缓解连作障碍方面的应用逐渐吸引了科研工作者的目光。本试验选用大豆黑农48（HN48）品种为试验材料,将连作大豆田中优势AM真菌-摩西管柄囊霉（Funneliformis mosseae,F.mosseae）分别接种于连作0年、连作1年、连作3年和连作5年土壤,对照组不接种F.mosseae。利用酸性品红溶液染色法和烘干法测定并统计大豆种植30d、60d和90d不同连作年限大豆根系菌根侵染率和大豆生物量,并采用高通量测序技术测定不同连作年限的细菌菌群结构。随连作年限提升大豆生物量均出现降低的趋势,接种F.mosseae的试验组样本明显高于不接菌的对照组,改善了大豆连作障碍现象。通过高通量测序结果证实,在大豆3个生育期中微生物多样性和物种丰度大体呈现出随着连作年限升高逐渐降低的趋势,在连作5年时数值最低,而在整个生育期中呈现出先升高后降低的态势,大豆种植60d时样本丰度与多样性指数最高。在3个时间点中,根际土壤细菌菌群多以有益菌属为优势菌,如:Gemmatimonas（芽单胞菌属）,Sphingomonas（鞘氨醇单胞菌属）,Bacillus（芽孢杆菌属）等,试验组的多种代谢功能也明显优于对照组,结果说明接种F.mosseae能够显著的改善根际土壤的细菌多样性,提高有益菌属的丰度,缓解被连作破坏的根际菌群结构。同时通过对菌属丰度分析后得知接种F.mosseae能够提高芽单胞菌属和鞘氨醇单胞菌属在3个时间点各个样本中的丰度占比,起到促进有益菌属增殖的效果。对于土壤理化性质结果的分析表明,随着连作年限升高部分理化性质出现先降低后增加的趋势,而另一部分理化性质则呈现出下降趋势,但接种F.mosseae后土壤理化性质指数有所回升,证实F.mosseae能够调节连作土壤理化环境。通过土壤理化性质与优势菌群的RDA图分析得知,优势有益细菌在大豆种植初期与多数理化因子呈正相关性,但到种植90d时与大多数理化性质成负相关性,即使仍有有益细菌的存在,但随着连作病原真菌的爆发,严重威胁到细菌的生态位,使理化性质与大部分细菌菌群表现出负相关性。综上所述,F.mosseae对连作大豆根际土壤的细菌菌群结构有较大影响,同时证明F.mosseae在提高根际土壤细菌丰度、改善代谢功能和提高土壤理化性质方面有促进作用。