巴西橡胶树遗传图谱第6、16号连锁群上16个标记的物理定位分析

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巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)属于大戟科橡胶树属,是一种多年生热带乔木。天然橡胶的主要来源是从橡胶树中产生的胶乳,具有十分重要的商业利用价值。前人已先后利用不同的分子标记技术构建了巴西橡胶树的多张遗传图谱,但是遗传图谱与染色体之间的关系尚不明确。将物理图谱和遗传图谱整合,构建分子细胞遗传学图谱,对于基因组序列的正确组装,序列拼接具有重要意义。本研究以巴西橡胶树热研7-33-97品种为材料,利用荧光原位杂交与原位PCR技术,选取Lespinasse等构建的橡胶树遗传图谱第6号和第16号连锁群上的16个RFLP标记,将这些标记定位到巴西橡胶树的染色体上,通过核型分析,从而确定这些标记在染色体的位置,以及连锁群和染色体的对应关系。研究结果如下:(1)来自第6号连锁群上的13个遗传标记被定位到了巴西橡胶树热研7-33-97的第3号染色体上,遗传图谱中连锁群上遗传标记排列顺序和在染色体上的位置顺序是一致的。其中 gHbCIR477、gHbCIR689.L1、gHbCIR140、gHbCIR207、gHbCIR 121、gHbCIR523.L1、gHbCIR150、gHbCIR 528这8个遗传标记在3号染色体的短臂上,信号位点到着丝粒的百分距离依次为56.55、37.59、33.16、28.78、21.51、17.79、15.67和 4.63,而 gHbCIR475、gHbCIR129/489、gHbCIR647.L1、gHbCIR396、gHbCIR675这5个遗传标记在3号染色体长臂上,信号位点到着丝粒的百分距离依次为28.02、30.96、51.04、53.69、66.34,着丝粒的位置在遗传标记gHbCIR528与遗传标记gHbCIR475 之间。(2)来自第16号连锁群上的6个遗传标记(gHbCIR421、gHbCIR588、gHbCIR647.L2、gHbCIR130、gHbCIR523.L2 和 gHbCIR689.L2)被定位到了巴西橡胶树热研7-33-97的第15号染色体上,并且遗传图谱中连锁群上遗传标记排列顺序和在染色体上的位置顺序是一致的。其中gHbCIR421、gHbCIR588、gHbCIR647.L2和gHbCIR130标记在15号染色体的短臂上,信号位点到着丝粒的百分距离依次为27.96、18.98、15.40 和 12.56,而 gHbCIR523.L2 和 gHbCIR689.L2 遗传标记在 15 号染色体的长臂上,信号位点到着丝粒的百分距为43.13和60.50,着丝粒的位置在遗传标记gHbCIR130与遗传标记gHbCIR523.L2之间。(3)通过第6号和第16号连锁群的定位结果,我们可以初步判定:Lespinasse等构建的遗传图谱上第6号连锁群与巴西橡胶树热研7-33-97的第3号染色体对应;第16号连锁群与巴西橡胶树热研7-33-97的第15号染色体对应。
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