大肠杆菌cyaY在铁硫簇生物合成中功能的研究

来源 :温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lizhuang1022
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目的:  为研究大肠杆菌中CyaY蛋白的功能,通过同源重组技术敲除大肠杆菌中编码这个蛋白的基因cyaY以及与其有相互作用的编码SodA和SodB蛋白的sodA和sodB,得到sodA-sodB-cyaY-基因缺失的三突变株,再将cyaY基因导入sodA-sodB-cyaY突变株中,在不同的条件下测定这些构建菌株的生长状态,为CyaY蛋白的功能研究提供实验基础。  方法:  1.大肠杆菌sodAsodB cyaY突变株的构建  1)打靶载体的制备根据哈佛大学网站提供的基因敲除的引物序列,送大连宝生物公司合成,通过两步交叉PCR反应,扩增出三个基因的读码框缺失片段sodA-、sodB-cyaY-克隆到低拷贝、条件复制基因敲除质粒工具pKOV内的NotⅠ、SalⅠ双酶切位点中,构建两个基因打靶载体:pKOV-sodA-、pKOV-sodB-、pKOV-cyaY-。  2) sodA、sodB和cyaY单个基因的敲除利用已构建好的打靶载体pKOV-sodA-、pKOV-sodB-、pKOV-cyaY-进行soda基因、sodB基因和cyaY基因的敲除。其敲除流程是:a)使用质粒小量提取试剂盒,从含有打靶载体pKOV-sodA-、pKOV-sodB-和pKOV-cyaY-的大肠杆菌DH5α中提取纯度较高的打靶载体pKOV-sodA-、pKOV-sodB-和pKOV-cyaY-;b)通过冷氯化钙法转化重组频繁的大肠杆菌株MC4100;c)经过转化的大肠杆菌涂布于氯霉素/LB平板并置42℃孵育,平板上存活的菌落表明重组pKOV质粒已成功整合进入基因组DNA,因为游离质粒不会在非允许温度下复制增殖;d)存活的菌落立即被置于含5%(w/v)蔗糖的LB平板上置30℃培养以选择发生第二次重组的大肠杆菌克隆。对蔗糖有抗性且对氯霉素敏感的细菌克隆被挑选出来,用作进一步分析,所选克隆通过针对目的基因sodA、sodB和cyaY两侧序列引物的PCR方法进行筛选,如果敲除成功,PCR扩增出不含基因soda、sodB和cyaY读框的片段,相反,扩增出与亲代一样的片段,证实敲除不成功。  3) sodA和sodB两个基因的敲除通过同样的敲除流程,在soda突变株基础上敲除sodB,得到soda和sodB两个基因缺失的突变株sodA-sodB-。  4) sodA和cyaY两个基因的敲除通过同样的敲除流程,在sodA突变株基础上敲除cyaY,得到soda和cyaY两个基因缺失的突变株sodA-cyaY-。其中,敲除流程和原来不同之处是:第二次同源重组条件改为,含5%(w/v)蔗糖的LB平板置30℃厌氧培养,其它条件不变。  5) sodB和eyaY两个基因的敲除通过同样的敲除流程,在sodB突变株基础上敲除cyay,得到sodB和cyaY两个基因缺失的突变株sodB-cyaY-。其中,敲除流程和原来不同之处是:第二次同源重组条件改为,含5%(w/v)蔗糖的LB平板置30℃厌氧培养,其它条件不变。  6) sodA、sodB和cyaY三基因的敲除通过同样的敲除流程,在sodAsodB突变株基础上敲除cyaY,得到sodA、sodB和cyaY三个基因缺失的突变株sodA-sodB-cyaY-。其中,敲除流程和原来不同之处是:第二次同源重组条件改为,含5%(w/v)蔗糖的LB平板置30℃厌氧培养,其它条件不变。  2.cyaY基因的导入  以野生型大肠杆菌MC4100的基因组为模板,用PCR方法分别扩增出cyaY基因,PCR产物经限制性内切酶NcoⅠ,EcoRⅠ双酶切,然后克隆入表达载体pBAD构建重组质粒pBAD-cyaY。将重组质粒pB AD-cyay转化到sodA-sodB-cyaY-三突变株,构建菌株pBAD-cyaY/sodA-sodB-cyaY-。  3.构建菌株生长状态测定  分别测定这些构建菌株的生长状态。  结果:  1.大肠杆菌sodAsodB cyaY三突变株的构建利用打靶载体pKOV-sodA-、pKOV-sodB-、pKOV-cyaY-获得sodA-单突变株,sodB-单突变株,cyaY-单突变株和及sodA-cyaY-、sodB-cyaY-、sodA-sodB-cyaY-突变株;PCR鉴定经琼脂糖凝胶电泳可见约1kp的目的条带。  2.cyaY基因的导入利用表达载体pBAD将cyaY导入到sodA-sodB-cyaY-突变株中,得到菌株pBAD-cyaY/sodA-sodB-cyaY-。PCR鉴定经琼脂糖凝胶电泳可见约300bp的目的条带;测序结果证实基因序列正确。  3.构建菌株生长状态测定通过以野生型大肠杆菌MC4100作为对照测定生长曲线,结果显示,在生理状态及氧化应激状态下对cyaY单突变菌株生长没有显著性区别;分别通过以soda,sodB单突变菌株作为对照测定生长曲线,结果显示,在生理状态及氧化应激状态下对sodAcyaY, sodBcyaY双突变菌株生长也没有显著性差异;而通过以sodAsodB双突变菌株作为对照测定生长曲线,结果显示,在生理状态及氧化应激状态下对sodAsodBcyaY突变菌株出现了显著性的区别,而pBAD-cyaY/sodAsodBcyaY突变菌株在氧化应激的状态下,可以恢复生长。  结论:  利用基因敲除技术成功获得sodA,sodB和cyaY单突变菌株,sodAsodB,sodAcyay,sodBcyaY双突变菌株以及sodAsodBcyaY三突变菌株。sodAsodB和sodAsodBcyaY在生理状态下,其生长状态没有显著性的差异;而在氧化应激的状态下,一定浓度的sodAsodB双突变菌株可以长出来,而相对应浓度的sodAsodBcyaY突变株却没有长出来;而在sodAsodBeyaY突变菌株中导入cyaY后,在氧化应激的状态下,可以恢复生长。说明CyaY在氧化应激的状态下是铁的伴侣分子,与形成铁硫簇有关。
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