民营科技企业是我国市场经济的重要组成部分,也是我国科技人员投身市场经济,实现科学技术向现实生产力转化的生力军。民营科技企业在科教兴国战略方针指导下已有长足发展,其经济活动已进入一些技术密集型领域和高新技术产业。随着民营科技企业的发展,一些问题也暴露出来,其中制度创新层面的问题比较突出,如产权问题、组织问题和管理问题等,这些问题阻碍着民营科技企业发展壮大。制度创新是民营科技企业生存与发展的基础,因为再好的技术若没有完善的制度作保证,也很难得到开发和推行,因此制度创新是民营科技企业发展壮大的动力基础。本文针对民营科技企业的内部制度创新问题展开讨论,在分析我国民营科技企业制度创新的特点和难点的基础上,提出民营科技企业制度创新的重点,然后对民营科技企业制度创新所表现的产权制度创新、组织制度与治理结构创新,以及管理创新三个方面进行尝试性探讨,以寻求民营科技企业内部制度创新的思路。