本论文由五节组成,第一节详细的论述了近10年来深海生境真菌次生代谢产物及生物活性的研究进展。第二节介绍一株深海来源的苏门达腊青霉菌（Penicillium sumatrense）化学成分及生物活性研究。第三节介绍一株深海来源的青霉菌（Penicillium biourgeianum）化学成分及生物活性研究。第四节介绍一株深海来源球毛壳真菌（Chaetomium globosum）的化学成分及生物活性研究。第五节为结论与讨论。我们运用多种波谱学分析方法与技术,包括手段IR（infrared spectra）、UV（ultra violet spectra）、NMR（Nuclear Magnetic Resonance）、MS（mass spectrum）、CD（circular dichroism）、Mosher’s反应等,从上述三株菌株苏门达腊青霉菌、青霉菌、球毛壳真菌中共分离鉴定了31个化合物,其中7个结构新颖化合物,24个已知化合物。化合物的主要结构类型包括大环内酯类（化合物1-6）、霉酚酸类（化合物7-13）、生物碱类（化合物15-23）、聚酮类（化合物26-31）,其中化合物1-4、7、15-16为新化合物。我们对不同类型的化合物进行了不同类型的生物活性测试。我们对大环内酯类化合物进行抑制NO生成的生物活性实验,其中,化合物6具有显著的抑制LPS诱导巨噬细胞RAW264.7产生NO的活性(IC₅₀为0.91μM,强于阳性对照药)。我们对霉酚酸类化合物进行了抑制甘蔗鞭黑粉菌二态型转变的生物活性实验,化合物8-10,12和13能显著抑制甘蔗鞭黑粉菌（Sprisorium.scitamineum）从酵母态向菌丝态的转化,但不直接杀死黑粉菌细胞。其中化合物8和化合物9活性最好,抑制黑粉二态型转变（dimorphic switch）的最低有效浓度分别为0.94μM和1.2μM。我们对吲哚大环生物碱类化合物进行细胞毒活性实验,其中,化合物20对乳腺癌细胞LNCaP和小鼠黑色素瘤高转移细胞B16F10有较强的细胞毒活性,其IC₅₀值分别为0.62μM和2.78μM。本文对三株深海来源的真菌中次生代谢产物及生物活性进行了的研究,从中分离鉴定了7个新结构化合物,部分化合显示出较强的生物活性。该研究结果表明了海洋天然产物化学结构及生物活性的多样性,为深入合理研发与利用海洋生物资源提供了科学基础。