毛叶枣(Zizyphus mauritiana Lam.)又名印度枣、西西果、台湾青枣，是鼠李科枣属热带亚热带优稀果树。毛叶枣果实脆甜可口、营养丰富，含有果糖、葡萄糖，维生素B、C，钙、磷、烟酸等，且毛叶枣成熟期一般为冬春季节，正值水果淡季，市场前景看好。但由于毛叶枣种质研究较少，命名的法则不规范，因此，极有可能造成同物异名或是同名异物现象。而且，随着毛叶枣产业的迅猛发展，表现出品种良莠不齐、果实的品质差等问题，已成为毛叶枣业蓬勃发展的瓶颈，因此，如何选育优良的品种、提高毛叶枣果实品质成为一个急需解决的问题。 本研究以21个毛叶枣种质为试验材料，通过对毛叶枣果实的外在品质、风味、内在品质的测定，并进行叶片的ISSR标记，旨在找出影响毛叶枣品质的主要指标和评价方法，建立毛叶枣ISSR反应体系，为毛叶枣的良种选育、品种鉴定与分类、遗传图谱的构建、分子辅助育种等奠定初步基础。结果表明： 1、毛叶枣果实的外观品质指标除果实纵径外，其余指标在品种间差异极显著，不同毛叶枣种质的单果重量介于25.59～99.02g之间，平均单果重为59.48g。果形指数在0.81～1.27之间，果形在卵圆形～长圆形之间；果皮颜色除福枣有微红外，其余均为黄绿色。 2、毛叶枣果实的风味主要是由糖、酸含量和糖/酸比决定。毛叶枣果实糖/酸比介于10.07～84.07之间，果实的风味主要决定因子为含酸量。 3、毛叶枣营养品质主要由糖、酸、维生素C等组成，毛叶枣不同种质可溶性总糖含糖量差异极显著，介于8.52～14.59％之间，平均为10.33％；毛叶枣果实的含酸量较低，平均为0.29％；毛叶枣各种质维生素C含量差异极显著，平均含量为42.48mg.100g-1。 4、通过主成分分析认为影响毛叶枣果实品质的主要因素是单果重、可食率和可溶性总糖。 5、通过模糊综合评判可筛选出所有种质中品质最好的是未知种，其次为蜜丝和图枣；最差的是缅甸圆果种。 6、通过果实品质模糊聚类分析，当λ=8.0时，可以将供试种质分为三类：I类为蜜丝、蜜枣、高朗一号、金蜜枣、大世界1、蜜枣2号、脆蜜、未知种、图枣、TJ10、大世界2、福枣、肉龙种、碧云种、留香枣共15份种质；II类：缅甸圆果、缅甸长果和滇刺枣；Ⅲ类为大果蜜枣、新世纪和蜜王。 7、使用改良的CTAB(小量)法可以有效的解决毛叶枣基因组总DNA提取中的褐化问题，提取的DNA的A260/A280介于1.7～1.9之间，说明具有较好的纯度，完全可以用于ISSR分析。 8、毛叶枣ISSR的最佳扩增程序：94℃预变性5 min；94℃变性45s，50℃退火1 min，72℃延伸2 min，35个循环；72℃延伸10 min后4℃保存。 9、毛叶枣ISSR反应的最佳体系为：在25μl的反应体系含2.59μL浓度为10×pCR的Buffer，3.75μL浓度为2.5mmol.L-1的dNTPs，1.5μL浓度为0.5U.gL-1的Taq酶，1.5μL浓度为5pm.μL-1的引物，0.75μL浓度为100ng.μL-1模板DNA，灭菌双蒸水15μL。 10、ISSR聚类分析，建立聚类分支树状图，以0.67为阀值将21份材料分为3个类群，第I类为蜜丝枣，第II类全部是来自台湾种群，第III类是来自中国的滇刺枣野生种，来自缅甸的缅甸长果种和缅甸圆果种。 11、从两种模糊聚类分析结果看出，21份毛叶枣种质不存在同物异名或同名异物现象，大世界1和大世界2为不同品种。