农民用水户协会运行监测是一个综合性的、复杂的系统工程。对农民用水户协会的组建、运行、管理进行监测与评价,以便及时掌握协会的发展进程,评价其取得的成效,找出运行过程中存在的问题,从而明确下一步的发展方向,对于协会的健康运行具有重要意义。本文在全面、系统综述国内外相关研究成果的基础上,以项目管理学和经济学做为科学指导,通过定量与定性研究,全面分析协会的运行效果以及运行过程中存在的问题。本文以内蒙古世行三期项目区内的用水户协会为案例,通过实地调查数据,将协会组建前后、协会与非组建协会区对比组进行对比分析,对成立农民用水户协会的效果进行客观评价,从而发现协会在组建与运行中遇到的一系列理论与实践问题:认识水平有待提高,协会治理结构方面存在的问题,按方计价执行率较低,供水不足及灌溉系统配套率较低导致协会运行不畅,协会运行经费来源渠道不畅,存在资金短缺问题,协会工作人员报酬较低,部分协会执委成员由村干部担任,章程的本地化不明显,针对性不强。最后对农民用水户协会的有效运行提出具体政策建议,包括进一步加强领导,加强宣传与培训工作,提高协会组建和运行水平,给予协会更多的权利,建立WUA的考核评价体系,对协会实施有效管理,加大支持力度,寻求多种途径,解决协会运行经费,保障协会的健康发展。