种质资源是育种工作的物质基础，是基因的储存库，种质资源积累了由自然和人工引起的极其丰富的遗传变异，蕴藏着各种性状的遗传基因，是生物多样性的重要组成部分，从多个层次对种质资源评价鉴别，发掘和开发利用与所期待的目标相一致的基因，是当前育种工作的核心任务之一。　　 百合（Lilium spp.）是百合科（Liliaceae）百合属（Lilium）所有植物的总称，为世界著名的观赏花卉，适合于盆栽，鲜切花和庭院绿化，还具有较高的食用药用价值，在国内外市场上占有重要地位。百合种质资源收集、评价和利用及其种质创新历来为国内外所重视，我国有着丰富的百合资源，但在百合种质创新方面十分薄弱，很少有较高观赏价值的商业品种问世。引进花卉育种技术先进的国家的优良百合种质资源并对其评价鉴定，通过栽培品种种质资源多样性状况的了解和评比，可以了解其优良品种遗传背景，各品种间的亲缘关系、生理差异，从而初步了解国际现有观赏百合种质资源多样性状况，引进和补充新优良基因资源，为国内百合新品种的研发工作建立基础和提供指导。　　 本研究对49个荷兰进口优良百合品种从株高，地径，叶宽，叶长等表型性状进行了表型多样性评价，同时利用AFLP分子标记技术，对优良百合品种的遗传多样性状况、亲缘关系以及育种背景进行了评价和分析，主要的研究结果如下：　　 1.通过对各百合品种的叶长、叶宽、叶长/叶宽、地径、株高5个表型性状的变异系数分析、变异水平方差分析、主成分分析，表明49个百合品种在这些表型性状上均存在着不同幅度的变异，且差异均达到显著水平，表型性状之间的差异主要表现为高生长的变异，其次是叶片形状的不同。　　 2.以百合5个表型性状指数为参数，采用最大距离法进行百合49个品种的聚类分析。结果表明，49个百合品种能够被所观测表型性状完全区分开，说明所调查的表型性状能够反映出各品种间存在明显差异，且品种之间的遗传变异丰富。在遗传距离的阈值为2.5时，49个百合品种被区分为2大类，第一大类为29个品种，分为7个品种群，第二大类为20个品种，分为两个品种群　　 3.针对百合叶片中多糖、蛋白质以及色素类等物质含量较高的特点，采用改良的CTAB法和SDS法从百合叶片中提取DNA，并进行效果比较，筛选出适于百合AFLP分析的基因组DNA最有效的提取方法。结果表明：在样品研磨过程中加入少量PVP，DNA提取液中加入2％CTAB，4μLβ-巯基乙醇和200μL5mol/LKac，重复冰无水乙醇沉淀，75％酒精多次洗涤，所提取百合的基因组DNA纯度高、基本无降解，适于AFLP分析要求。　　 4.确定了百合AFLP分析过程中的最佳DNA模板浓度，最佳Mg2+浓度，最佳dNTP浓度，最佳Taq聚合酶浓度，最佳引物浓度，建立了适合百合AFLP技术的最佳反应体系，完成了DNA的酶切和连接预扩增、选择性扩增等试验过程，利用EcoRI和PstI进行双酶切，从64对EcoRI/PstI引物中筛选出6对清晰、多态性高的引物，对48个不同品种百合样本进行了AFLP分析，都得到了清晰的指纹图谱，并且表现出较好的多态性。6对引物共扩增出459个可统计标记，其中多态性标记406个，多态带百分率为88.5％，平均每对引物扩增76.5条带。多态性片段长度主要分布在120-900bp的范围内。多态性最高的为引物组合P59/E34，高达91.7％，最低的是P45/E42，多态性为85.5％。运用Popgene3.2软件计算出各位点不同品种的频率分布，得到48个样本总的遗传多样性为h=0.2570，Shannon信息指数I=0.3993。揭示了48个百合品种具有丰富的遗传多样性，其遗传背景较复杂，品种问存在丰富的变异。　　 5.对指纹图谱进行判读，构建0、1矩阵。利用POPGENE1.32软件计算遗传多样性指数，基于Nei’s遗传距离采用UPGMA法进行聚类分析。根据AFLP聚类分析结果把48个百合品种分为2大类群，第一大类包括3个品种，第二大类包括45个品种，进一步可划分为12个亚群。　　 6.表型性状和AFLP分子标记的多样性分析评价均表明49个百合品种间存在丰富的变异。根据百合品种的表型与AFLP的聚类关系比较分析，共有19个品种的聚类关系在表型聚类与AFLP聚类中存在差异，30个品种在表型聚类和AFLP聚类中均处于同一分支，其中有13个品种的聚类关系在两种聚类中完全一致。说明形态标记与分子标记分析相互结合，相互补充可以对百合品种资源做出更科学、更合理、更准确地评价。