在当今全球化和高度竞争的环境中，创新无疑已成为许多国家的首要政策议程。作为上市企业的重要组成的高新技术企业，拥有独特的创新性和高增长性等特征，已成为促进我国经济迅速发展的重要力量。由于存在诸如知识溢出之类的市场失灵，企业在创新活动中的支出通常不是最优的，并且已为大多数学者所认可。为了解决这个问题，实现资源的最佳配置并不断提高创新效率，各国政府已开始通过使用研发资金、项目支持、税收优惠和其他政策工具和措施进行干预。这些政府干预的主要目的是降低研发的实际成本，诱使企业在研发上花费，并最终提高创新活动的效率。随着政府干预的兴起，关于政府干预必要性的讨论一直是学术界和实践界的争论焦点。近年来，中国在企业层面不断增加研发资金和支持。然而，基于中国的经济基本发展状况，政府R&D的高投入并不一定能带来创新效率的正比提高，并且区域间、企业间的差异也非常大，这使得对本文的研究具备更深层次的意义和价值。
　　本文选取A股高新技术上市企业为研究对象，通过运用DEA方法对企业的创新效率进行测度，并进一步展开实证研究，来分析政府的R&D资助是否对高新技术企业的创新效率产生影响，并判断影响的大小，和影响的正负关系。全文的研究从国内外文献综述入手，利用三阶段DEA对我国高新技术企业的创新效率进行了测度，并对不同企业规模和各区域间的创新效率差异进行分析。运用Tobit模型进一步研究了政府补贴、税收优惠对高新企业创新效率的影响，并且运用断点回归研究了政府创新驱动政策对高新企业创新效率的影响，最终提出若干政策建议。
　　实证结果表明，中国创新的整体效率相对较低。虽然逐年稳步增长，但增长速度很慢。由于区域发展不均衡和政府支持资金量的差异，各城市群的创新效率也不同；政府补贴与高新技术企业的创新效率负相关，税收优惠与高新技术企业的创新效率正相关；政府创新驱动政策在刺激企业创新活动方面没有发挥重要作用。对此，我国高新技术企业应增加企业创新的资金投入力度，鼓励企业加大创新规模，进而扩大企业规模，对企业所支配的资源进行合理的配置，从而提高企业运用资金的效率，提高企业的创新效率。政府还应该加大对高科技企业的支持力度，帮助它们提高效率。对于每个城市群，政府可以出台相应的政策，重点关注中西部城市群的支出，同时鼓励东部城市群向中西部地区转移创新，整合科技产业，形成更多的高新技术产业园区。