目的本课题主要通过研究间日疟原虫环子孢子蛋白(PvCSP)基因多态性特征,对我省本地和输入的间日疟原虫进行基因型分析。材料和方法2008年-2013年间,在河南省范围内收集经镜检和PCR双重方法确定的间日疟病人血标本,取患者外周血或静脉血制作成滤纸血,供DNA提取用。根据PvCSP序列特征设计特异性引物,经巢式PCR扩增后,对扩增产物进行正反双向测序,测序结果用ChromasPro软件进行拼接,然后在NCBI中BLAST查找,看有无相同序列,进而与Genbank中的CSP基因进行比对分析,选取国内外代表株,对其核苷酸和氨基酸序列进行比对,采用mega40绘制进化树。结果(1)52份间口疟原虫现场分离株经巢式PCR扩增,均能扩增出一条600-750bp的条带,用恶性疟患者及健康人标本对照未扩增出任何条带。(2)52份间日疟原虫分离株中,51份属VK210型,只有一份来自腾冲的虫株属VK247型,河南省本地的32份间日疟原虫分离株均属于VK210型。(3)32份本地PvCSP中央重复单位的数目在20-22之间,在中央重复区后,本地PvCSP氨基酸序列均能见到一段12肽的插入序列：GGNAANKKAEDA,插入序列之后大部分本地株出现重复两次的亚重复单位：GGNA;20份输入的间日疟患者血样中,共观察到VK210型的6种不同的序列,PvCSP中央重复区重复单位的数目在17-19之间,部分虫株出现了中央重复区后12肽的插入序列,GGNA亚重复单位的数目分别为1、2、3、5、6、7。(4)河南本地PvCSP序列主要有两种：VK210A(33.33%)和VK210G(42.42%)。与VK210重复单位基本序列相比,本地PvCS P序列有75%以上的中央重复单位至少有一个非沉默的碱基变换。9肽单位氨基酸序列观察到了7种变化,重复单位的变异主要发生在第3、4、6、7、9、14、21、22核苷酸,其中,第3、21核苷酸常发生沉默的碱基变换,第4、7、9、14、22核苷酸常发生非沉默的碱基变换,而第6核苷酸既可以发生沉默的碱基变换,又可以发生非沉默的碱基变换。(5)本地PvCSP可以分为2个基因亚型A和B,亚型A又可以进一步划分为A1、A2、A3。在本地序列各个亚型中任选一个序列与输入性序列及Genbank中的序列做同源性分析：A1、A2、A33型的同源性为91.9%-96.0%,与M28746的同源性为89.8%-94.0%,与U08977的同源性为93.3%-97.4%,与M28745的同源性为16.8%-21.2%；基因亚型B与M28746的同源性为71.7%；与U08977的同源性为72.5%,与M28745的同源性为35.7%。HNSR27与M28745的同源性为99.3%,与AF316584的同源性为97.4%,与M28746的同源性为13.7%。结论河南省间日疟原虫CSP基因属VK210型,共观察到八种不同的序列；河南省PvCSP与非洲、东南亚等疟区输入的PvCSP差异较大,与中国贵州株、朝鲜株PvCSP相似但仍可以区分。