“十二五”时期是实现全面建设小康社会奋斗目标承上启下的关键时期，是深入贯彻落实科学发展观、构建社会主义和谐社会、实现克州经济跨越式发展的重要时期，也是加快克州工业化进程的攻坚时期。在国内外发展环境错综复杂，不确定、不稳定因素增多的背景下，科学编制和实施好“十二五”规划，对于积极适应发展形势的新变化，妥善应对经济社会发展的新挑战，全面落实建设小康社会的新要求，顺利推进中国特色社会主义现代化建设，实现环境与经济协调可持续发展具有重大意义。本文以国家贫困连片区域新疆克孜勒苏柯尔克孜自治州（简称“克州”）为研究对象，利用环境保护规划的理论与方法，对克州“十二五”环境保护规划进行了编制研究。本文首先对环境保护规划基本知识和规划的理论基础进行了综述，总结了国内外环境保护规划的研究现状，并对区域环境保护规划的内容和编制的程序进行探讨；其次，在借鉴国内外学者相关研究成果及已有的国家、地方相关指标体系的基础上，结合国家级贫困地区的实际情况，对已发表论文中指标体系的内容进行了统计筛选，遵照评价指标体系的构建原则，提出了一套符合国家极贫困地区区域特殊性的环境保护规划指标体系，其包含环境质量、污染防治、生态环境建设、环境管理、社会经济指标等五个方面共22项指标，并采用层次分析法和特尔斐法相结合确定了各项指标的权重并进行了权重分析；最后，将构建的国家极贫困地区环境保护规划指标体系运用到新疆克州地区，编制完成了克州“十二五”环境保护规划。