抗冻蛋白又称热滞蛋白、冰结合蛋白,是一种具有特殊生物功能的蛋白质。在溶液中它能够吸附到冰晶表面,非依数性的降低溶液的冰晶生长点温度,抑制冰晶的生长,而不影响冰晶的熔点温度,产生热滞现象。近些年越来越多的抗冻蛋白的氨基酸序列被测定出来,但是结构信息依然很少,抗冻蛋白与冰晶结合的作用机制仍然没有搞清楚。利用信息学的方法,从抗冻蛋白的氨基酸序列入手,通过分析抗冻蛋白氨基酸序列组分信息和物理化学特性并寻找特殊序列模体,对于理解抗冻蛋白与冰晶的结合机制是非常必要的。本文从UniProt数据库中下载得到了594个抗冻蛋白,并按照来源物种进行分类。利用MEME模体搜索工具,分别提取了不同种类抗冻蛋白序列的模体,得到几个重要的模体,在这些模体序列中疏水氨基酸占很大的比重。本文选取20种氨基酸组分、400种二肽组分、物理化学特征组分以及二肽组分作为支持向量机的参数,在Jackknife检验下,对抗冻蛋白进行预测。把这594个抗冻蛋白作为正集,把从PISCES软件得到600个非抗冻蛋白作为负集。根据氨基酸的亲疏水性、酸碱性、极性和氨基酸R基的化学结构,把20种氨基酸分别约化为6类、3类、4类和6类。得到的最好预测结果是：敏感性93.14%,特异性96.08%,总的预测成功率94.62%,Matthews相关系数0.8927。结果分析表明：氨基酸的亲疏水性和氨基酸R基的化学结构这两种物理化学特征作为特征参数,对于预测抗冻蛋白是重要的。