河豚毒素适体的SELEX筛选与应用研究

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本文应用核酸适体筛选技术(SELEX技术),从庞大的随机ssDNA文库中筛选获得与河豚毒素(TTX)具有特异性强、亲和力高的寡核苷酸适体(aptamer),并对其应用进行初步探索,为应用核酸适体检测河豚毒素奠定基础。人工合成两端为固定序列、中间为35个随机序列、全长为78nt的ssDNA文库,用环氧基树脂(Epoxy)活化的丙烯酸珠子作为固相分离介质偶联河豚毒素,结合诱变PCR技术,进行河豚毒素适体的SELEX筛选。筛选过程中优化了PCR扩增条件以及用Epoxy活化丙烯酸珠子偶联甘氨酸并进行反筛。经过13轮的筛选,对获得的适体群进行克隆,随机挑取19个克隆子,经鉴定后测序。对测序合格的适体进行一级结构和二级结构分析以及亲和力测定。基于绿色荧光核酸染料EvaGreen与核酸适体-TTX复合物的作用,建立了 TTX的适体荧光检测方法。SELEX筛选结果表明,每轮ssDNA的富集文库与靶分子的结合率呈上升趋势,结合显色后吸光度值从第1轮的0.235上升到第13轮的0.936,提高了 4.0倍。通过对一级结构的同源性分析,发现有6条适体序列几乎完全相同(其中有4条序列完全一致,其余2条仅有1~2个碱基的差异)、3条适体序列完全一致,表明一级结构相同或相近的适体在一定程度上得到富集。适体结构模拟显示二级结构主要以茎环状结构为主,表明这些茎环结构是适体与靶分子结合的基础。适体与靶分子的结合试验表明,A3号单克隆适体的结合率最大。适体荧光检测方法优化结果表明:A3号单克隆适体与TTX结合的最适pH值为7.5,染料最佳结合时间为1Omin,检测低限为10-6mol/L。
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