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研究背景IgA肾病（IgA nephropathy,IgAN）是一种常见的原发性肾小球肾炎疾病,占肾活检患者的30%～45%,其特征是肾小球系膜区以IgA为主的免疫复合物沉积。临床表现多种多样,主要表现为血尿,可伴有不同程度的蛋白尿、高血压和肾功能受损。IgAN致病机制与多种因素有关,但具体的致病机制尚未阐明。定量蛋白组学（Quantitative proteomics）发现了多种潜在的蛋白标志物,但仍未有IgAN特异性的蛋白标志物。目前IgAN蛋白磷酸化研究较少,本研究采用定量蛋白组学和磷酸化蛋白组学（Phosphoproteomics）分析IgAN肾组织,揭示与IgAN相关的蛋白和IgAN肾组织的磷酸化修饰特征。目的从蛋白组学水平筛选IgAN发病相关的蛋白;对IgA肾组织蛋白进行磷酸化位点分析,预测修饰位点上游激酶,构建激酶-蛋白网络图,揭示IgAN磷酸化特征,为IgAN分子诊断标志物及发病机制研究提供新的依据。方法本研究疾病组为确诊的IgAN患者（n=7例）,对照组为确诊的轻度肾小球异常患者（Minor glomerular abnormalities,MGA）（n=10例）。首先,提取疾病组和对照组肾组织的蛋白,BCA试剂盒检测蛋白质的浓度。其次,采用胰蛋白酶将蛋白酶解成肽段,肽段用于定量蛋白组学和蛋白磷酸化组学分析。运用现代生物信息的方法分析数据,对差异表达的蛋白进行蛋白注释、GO、KEGG及结构域等功能富集分析。MCODE和Cyto Hubba筛选与IgAN相关的差异蛋白和差异磷酸化蛋白。i GPS1.0软件对磷酸化位点上游激酶预测,筛选疾病组和对照组中差异表达的激酶。结果1蛋白组学（1）本研究共鉴定到蛋白4360个,其中2894个具有定量信息。筛选到上调蛋白227个（>2倍）,下调蛋白263个（<1/2倍）。（2）对蛋白进行注释,发现差异蛋白主要分布在细胞质中,共146个。（3）对蛋白进行功能富集分析。GO富集在细胞外基质和免疫系统发育及离子运输等生物功能中;KEGG富集在原发性免疫缺陷和氨基酸代谢等信号通路;结构域富集在C型凝集素折叠和金属硫蛋白结构域。（4）由MCODE和Cyto Hubba筛选出6种可能与IgAN相关的核糖体蛋白:核糖体蛋白L23（RPL23）、核糖体蛋白L11（RPL11）、核糖体蛋白S15A（RPS15A）、核糖体蛋白L32（RPL32）、核糖体蛋白L13（RPS13）、核糖体蛋白S8（RPS8）。2磷酸化蛋白组学（1）本研究共鉴定到279个差异磷酸化蛋白,其中上调磷酸化蛋白99个（>2倍）和下调磷酸化蛋白180个（<1/2倍）。（2）对磷酸化蛋白进行注释,发现磷酸化修饰蛋白主要分布在核中,共126个。（3）对磷酸化蛋白进行功能富集分析。GO富集在锚定接点、肌动蛋白结合等多项功能中;KEGG富集在HIF-1信号通路和PI3K-Akt信号通路等多条信号通路;结构域富集在锌指,LIM型结构域。（4）对磷酸化位点上游激酶进行预测,鉴定到225个激酶,其中65激酶处于激活状态,160个激酶处于抑制状态。（5）筛选CDK2,CDK5,CK2A1,CK2A2,ERK1及ERK2激酶构建激酶-磷酸化位点网络图。结合MCODE和Cyto Hubba分析筛选出6个与IgAN相关的磷酸化蛋白,如桩蛋白（PXN）,核糖体蛋白S3（RPS3）,核糖体蛋白S27（RPS27）,黏着斑蛋白（VCL）,嗜热菌蛋白酶（TLN）及热休克蛋白AA1（HSP90AA1）等磷酸化蛋白。结论（1）定量蛋白组学筛选到227个上调蛋白和263个下调蛋白。筛选出RPL23,RPL11,RPS15A,RPL32,RPS13和RPS8可能与IgAN发病机制相关的蛋白。（2）磷酸化蛋白组学筛选到99个上调蛋白180个下调蛋白。（3）筛选出PXN,RPS3,RPS27,VCL,TLN和HSP90AA1等磷酸化蛋白可能与IgAN发病机制相关。（4）本研究筛选出来的蛋白和磷酸化蛋白可作为IgAN潜在分子标记物,为阐明IgAN发病机制提供新思路。