内部控制作为一种契约安排，对于有效防范差错、促进企业经营目标的实现、提高经营效率起着非常重要的作用。过去，我们在内部控制失效时总是从系统内部的相互牵制、相互监督及相互复核等工作程序上寻找原因，而没有充分意识到内部控制和治理控制、管理控制、会计控制相互脱节以及治理控制、管理控制、会计控制本身存在的缺陷所导致的内部控制失败的问题。实际上，如果没有完善的治理控制、管理控制、会计控制及其与内部控制的有效衔接，即使是严密、健全的内部控制制度也很难取得预期的控制成效。因此，为了从根源上实施有效的内部控制，必须将内部控制与治理控制、管理控制、会计控制相结合。 本文从系统的角度，探讨了治理控制、管理控制、会计控制对内部控制的影响。首先，从经济学的视角出发，根据委托代理关系，将内部控制分为治理控制、管理控制、会计控制三个层次；其次，运用路径图的方法阐述了治理控制、管理控制、会计控制三者之间的关系及其对内部控制的直接和间接影响：再次，在有关理论的基础之上，本文收集我国制造业上市公司2006、2007两年的数据，通过主成分分析法和多元线性回归法，分析了我国制造业上市公司治理控制、管理控制、会计控制对内部控制效率的影响。实证结果表明：治理控制与内部控制效率不显著相关；会计控制、管理控制对内部控制效率的提高能起到一定的积极作用；其它因素尽管表现出一定的相关关系，但从总体上没有通过显著性检验。基于上述结论，本文提出了优化公司治理结构(防止内部人控制)，包括优化股权结构、完善董事会机构；加强公司治理控制、管理控制、会计控制之间的无缝对接，包括建立稳健有效的企业内部组织架构、建立流畅有序的流程管理、加强信息交流与沟通，从而完善企业内部控制系统的建议。