拟南芥AtDPBF4基因克隆及生物信息学分析与表达研究

来源 :兰州理工大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:liuhui098
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
逆境条件下逆境相关的转录因子能够调节功能基因的表达,已经是众所周知的事情,由此转录因子的研究成为许多研究人员的一个新的课题,以期在基因转录水平上阐述干旱、耐盐碱等作用机理,本论文以拟南芥为研究对象,克隆转录因子ABl5家族中最小成员AtDPBF4基因,并对其序列进行生物信息学分析,在大肠杆菌中进行表达,得到纯化的目的蛋白,这对于研究该蛋白的生理学功能具有重要意义,从而为进一步研究AtDPBF4基因在拟南芥生长发育调控过程中发挥的作用奠定研究基础。具体研究内容和结果如下:(1) AtDPBF4基因的分子克隆:以NCBI数据库中的拟南芥DPBF4基因的cDNA序列为参考序列,结合后期表达载体pET-32a的序列特征,设计上游引物和下游引物,用高保真DNA聚合酶通过RT-PCR的方法扩增得到了AtDPBF4基因。将其与克隆载体pMD-T Vector连接,得到重组质粒pM-AtDPBF4。经测序结果表明克隆得到的AtDPBF4基因全长789bp,总共编码263个氨基酸。(2)对AtDPBF4基因序列编码的氨基酸的理化性质、细胞内定位、保守结构及高级结构进行生物信息学分析。并基于NCBI数据库中与其同源性很高的序列构建了基因进化树。结果表明:该基因可编码一条理论分子质量为29.19kD的氨基酸,并由14个α螺旋、6个β折叠、1个β转角和10个无规卷曲组成的二级结构,在188-260氨基酸之间是一个BRLZ结构域,包含一个锌指结构。该结构域在DNA转录调控中起作用,三级结构预测表明该蛋白质在空间主要以α螺旋存在。采用近邻结合法(neighbor-joining)将NCBI中与AtDPBF4同源性大于95%以上的部分序列构建进化树,显示该基因都属于ABI家族。(3) AtDPBF4基因原核表达载体的体外构建及原核表达:对质粒pET-32a和重组质粒pM-AtDPBF4用限制性内切酶BamH I和Nco I进行双酶切,经体外连接构建正确的重组表达质粒pET-AtDPBF4,选择BL21(DE3)作为宿主细胞进行转化,获得BL21/pET32a-ABI5原核表达菌株,经IPTG诱导表达,分析得知主要以可溶性蛋白表达形式存在,并研究了不同诱导剂浓度、诱导时间、诱导温度对重组蛋白表达量的影响。SDS-PAGE分析重组蛋白表达情况,结果表明:AtDPBF4在大肠杆菌中表达的适宜条件为:诱导剂浓度0.5mmol/L、诱导时间4h、诱导温度37℃。
其他文献
目的:观察综合疗法对急性小腿三头肌损伤的临床治疗效果。方法:选择47例急性小腿三头肌损伤患者为研究对象,采用早期处理、穿刺抽吸瘀血并妥善固定、中药治疗、针灸、手法治
<正>"身体是革命的本钱",但是,在繁忙的生活中,大家往往是忙于工作,急于应酬,却忽略了身体健康这块风水宝地。其实,平时稍加注意,提早预防,健康就在我们身边。想健康一辈子离
针对协作通信系统能量有限和误码率高等问题,在DF协作通信系统中,研究一种基于误码率的概率分配算法。在总发射功率一定的条件下,建立以满足最小误码率为目标的优化问题。利
超重和肥胖逐渐成为全球性问题,减重手术可以改善肥胖带来的生活质量降低和心理压力增加,是一个有效且安全的选择,减重手术后所产生的皮肤冗余问题则需要形体雕塑来解决,本文
为了明确分布式光伏并网对配电网网络损耗的影响,并给出合理的分布式光伏并网规划方案,首先总结了配电网网损的计算方法,并通过真实配电网作为算例,利用DIgSILENT仿真软件建
目的:比较三七制剂治疗不同类型中风的疗效优势。方法:运用系统评价方法,检索三七制剂治疗中风的随机对照试验,筛选合格研究,评价纳入研究质量,采用Meta-分析、异质性检验、
位于巴黎市中心塞纳河右岸的卢浮宫,既是一座具有文艺复兴时期风格的金碧辉煌的王宫,又是一座因藏有大量法国和世界各地艺术珍品而闻名遐迩的博物馆,因而每天都吸引着成千上万来
报纸
埋入堆叠芯片技术在实现封装小型化的同时,增加了封装电学设计的复杂性。以一个数字系统为例,详细阐述了埋入堆叠芯片封装结构的电学设计过程。利用电磁仿真软件提取了该封装
目的:系统评价血塞通注射液疗缺血性中风急性期的临床疗效。方法:搜集血塞通注射液治疗缺血性中风急性期随机对照试验文献,筛选合格研究,应用Jadad评分法进行质量评价,运用异
在一台JL368Q3多点电喷汽油机上,开展了乙醇汽油(不同掺混比)发动机排放特性的研究,并用GC 2010气相色谱仪测量了排气中未燃醇醛的排放浓度.试验结果表明:在发动机运转参数相