夏大豆种子活力相关性状的QTL定位分析

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bostangul
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大豆是重要的农作物之一,在中国大豆产业亟待振兴的背景下,提高大豆种子活力,可以减少生产成本,增加农民的经济效益。本研究选用活力差异大的贡378-1和雅安黑豆构建的重组自交系为试验材料,进行2018年和2019年不同种植年份下,当年新收获种子和人工老化种子的种子活力相关性状(发芽势、发芽率、发芽指数、活力指数、株高、粒重、平均发芽时间、发芽率达到50%的时间、蛋白质含量、油脂含量、电导率和田间出苗率)的表型测定,基于BSA分析方法和全基因组重测序技术,检测大豆种子活力相关差异区段,设计Indel标记,对夏大豆种子活力相关性状进行QTL定位分析。主要研究结果如下:1.在新收获种子和老化种子中,亲本的大部分种子活力相关性状均差异显著或极显著。在新收获种子和老化种子中,RIL群体种子活力相关性状变异丰富,超亲分离普遍存在,各性状分布呈正态分布,符合数量性状遗传特征。RIL群体新种子和老化种子种子活力相关性状在家系间均差异极显著。RIL群体新种子与种子活力相关性状如粒重、电导率等在年份间差异显著或极显著;粒重、电导率、蛋白质含量、油脂含量等性状在年份和家系的相互作用下差异显著或极显著;RIL群体中老化种子的粒重在年份间、年份和家系的相互作用下差异极显著。2.基于BSA分析方法,通过对亲本贡378-1、亲本雅安黑豆,以及两极端混池共4个DNA样品进行全基因组重测序,得到6条染色体上与种子活力相关的6个差异区段,并设计了Indel标记。根据6个差异区段优先、均匀的选择了分别覆盖在6个区段的Indel标记,成功筛选出38对具有多态性的标记。3.利用完备区间作图法(ICIM)共检测到20个与种子活力相关的加性QTL,解释了7.93%~27.92%的表型变异。其中,新收获种子中检测到17个与种子活力相关的QTL,解释了7.93%~27.92%的表型变异。其中控制田间出苗率的q FGP-2-1与控制粒重的q W-2-1在2号染色体上构成QTL簇,控制蛋白质含量的q P-5-1和控制油脂含量的q O-5-1在5号染色体上构成QTL簇。两年定位到控制活力指数的q VI-6-1,位置相近,构成一个QTL簇,两年重复定位到控制发芽指数的q GI-2-1。老化种子中检测到3个与种子活力相关的QTL,解释了12.77%~17.91%的表型变异。
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