公司治理问题一直是理论界和实务界共同关注的聚焦点。由于我国特殊的制度背景，“一股独大”、“控股股东”的现象存在于大部分上市公司，控股股东与中小股东之间的代理问题已成为公司治理的核心问题。随着近年来我国风险投资的兴起与发展，风险投资机构在保护中小股东利益中的作用也日益引起人们的注意。　　 本文以中小股东利益为一条研究主线，基于相关问题的文献评述，利用“增长差距”刻画中小股东利益受损程度，首先，从风险投资机构持股比例角度来探讨风险投资机构持股是否影响中小股东利益保护，以及如何影响，进一步地，笔者引入风险投资机构声誉，以风险投资机构股权性质来刻画风险投资机构声誉，从而从另一层面上来探讨风险投资机构持股对中小股东利益保护的影响。研究发现:风险投资机构持股与中小股东利益之间在主板、中小板和创业板市场呈现不同的特征。(1)在主板市场上，风险投资机构持股比例越高，中小股东利益受损越严重;相比其他样本公司，具有国有性质的风险投资机构持股的样本公司的中小股东利益能受到更好地保护;风险投资机构从业历史越长越能保护中小股东利益。(2)在中小板市场上，风险投资机构持股比例越高，中小股东利益受损越严重;相比其他样本公司，具有国有性质的风险投资机构持股的样本公司的中小股东利益受损更严重;风险投资机构从业时间越长，样本公司中小股东利益受损越严重。(3)在创业板市场上，随着风险投资机构持股比例的提高，中小股东利益受到更好地保护;相比其他样本公司，具有国有性质的风险投资机构持股的样本公司的中小股东利益能受到更好地保护;风险投资机构从业历史越悠久越能保护样本公司中小股东利益。